More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2533 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.1 
 
 
257 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2661  short chain dehydrogenase  60.7 
 
 
257 aa  324  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.75 
 
 
257 aa  316  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.98 
 
 
257 aa  313  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5816  short chain dehydrogenase  61.48 
 
 
257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0811  short chain dehydrogenase  59.53 
 
 
271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0487  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 
257 aa  309  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2404  short chain dehydrogenase  61.09 
 
 
257 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0875536  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2533  short chain dehydrogenase  61.09 
 
 
257 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1873  short chain dehydrogenase  61.09 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2484  short chain dehydrogenase  61.09 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2509  short chain dehydrogenase  60.7 
 
 
257 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.37 
 
 
257 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.42 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1409  short chain dehydrogenase  56.03 
 
 
257 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0200638  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0521  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 
257 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0631  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 
257 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1431  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 
257 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1462  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 
257 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3055  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 
257 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1565  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 
257 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1236  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 
257 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0250043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2817  short chain dehydrogenase  56.03 
 
 
257 aa  285  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96434  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.956492  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0078  short chain dehydrogenase  54.37 
 
 
252 aa  267  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2236  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 
257 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26310  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 
257 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.29422  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  50.79 
 
 
247 aa  254  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02490  conserved hypothetical protein  45.61 
 
 
279 aa  228  5e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495074  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58869  short-chain dehydrogenase, 2,4- dienoyl-CoA reductase  47.64 
 
 
256 aa  222  6e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.947206  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65964  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  47.49 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.647739  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
286 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
246 aa  172  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
246 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
247 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.46 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372073  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
246 aa  161  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
247 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
247 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
247 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.86 
 
 
269 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  35.2 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
246 aa  144  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
246 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
260 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
247 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
250 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
245 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 
247 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
245 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.65 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.65 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.65 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.65 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.65 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  33.72 
 
 
265 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
246 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  34.23 
 
 
264 aa  136  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
244 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.02 
 
 
246 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
254 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  34.25 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
271 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
245 aa  131  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.32 
 
 
246 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.92 
 
 
246 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.821225  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
249 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
247 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  34.12 
 
 
247 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
249 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
245 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
245 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
250 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
256 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
247 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.97 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>