245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1935 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  100 
 
 		 448 aa  885    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  63.27 
 
 		 448 aa  581  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  52 
 
 		 454 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  53.6 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  53.71 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  54.16 
 
 		 448 aa  463  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  52.13 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  52.7 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  50.9 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  50.56 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  48.86 
 
 		 452 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  49.77 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  52.53 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  47.75 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  47.75 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  47.75 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  47.1 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  47.85 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  47.52 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0460  sodium:neurotransmitter symporter  49.88 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  36.77 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  37.93 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  34.4 
 
 		 473 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  37.31 
 
 		 474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  33.91 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  39.17 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  34.77 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  34.98 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  35.5 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.59 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  37.2 
 
 		 452 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  36.03 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  36.38 
 
 		 470 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.18 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  34.35 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  36.6 
 
 		 464 aa  236  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  33.41 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  34.79 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 452 aa  229  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.78 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  37.31 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  33.41 
 
 		 444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  35.48 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  35.43 
 
 		 461 aa  226  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  35.51 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  35.48 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.27 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  35.27 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  35.05 
 
 		 446 aa  224  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  35.27 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  35.27 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  33.19 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  34.99 
 
 		 464 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  32.97 
 
 		 444 aa  223  7e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.05 
 
 		 446 aa  223  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  35.05 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  35.05 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  32.54 
 
 		 447 aa  220  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  36.98 
 
 		 451 aa  221  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  34.18 
 
 		 459 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  34.55 
 
 		 437 aa  220  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  34.26 
 
 		 486 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  34.49 
 
 		 455 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  34.53 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  37.3 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  35.43 
 
 		 453 aa  217  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  33.78 
 
 		 486 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  34.13 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  33.99 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  36.03 
 
 		 455 aa  216  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  33.48 
 
 		 453 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  30.84 
 
 		 458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  33.91 
 
 		 457 aa  213  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  34.97 
 
 		 466 aa  212  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  34.44 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  32.76 
 
 		 453 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  35.01 
 
 		 450 aa  210  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  38.71 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  34.45 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  37.99 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  37.99 
 
 		 447 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  30.19 
 
 		 454 aa  206  5e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  31.82 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  34.76 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  32.15 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  32.63 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  35.06 
 
 		 486 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  31.02 
 
 		 450 aa  203  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  31.33 
 
 		 447 aa  203  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  31.98 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  32.12 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  31.97 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  33.55 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  32.14 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  31.11 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  31.11 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1198  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  31.58 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  34.51 
 
 		 445 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>