More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06458 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06458  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 202 aa  416  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  96.53 
 
 		 504 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  96.53 
 
 		 504 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  96.04 
 
 		 504 aa  401  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  99.47 
 
 		 489 aa  380  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  92.55 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  92.55 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  92.55 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  92.55 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  92.55 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  92.55 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  90.96 
 
 		 490 aa  357  5e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  86.7 
 
 		 490 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  86.7 
 
 		 490 aa  340  7e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  86.7 
 
 		 490 aa  340  7e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  86.7 
 
 		 490 aa  340  7e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  84.57 
 
 		 490 aa  330  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  82.98 
 
 		 490 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  82.98 
 
 		 490 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  82.98 
 
 		 490 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  82.98 
 
 		 490 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  96.15 
 
 		 458 aa  313  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  61.62 
 
 		 490 aa  238  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  61.58 
 
 		 495 aa  231  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  61.58 
 
 		 495 aa  231  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  63.28 
 
 		 495 aa  230  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  58.01 
 
 		 560 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  58.01 
 
 		 560 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  61.58 
 
 		 495 aa  224  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  58.6 
 
 		 503 aa  221  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  62.13 
 
 		 505 aa  215  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  56.59 
 
 		 568 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  59.54 
 
 		 549 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  59.22 
 
 		 503 aa  212  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  55.26 
 
 		 561 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  53.85 
 
 		 568 aa  208  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  55.61 
 
 		 556 aa  208  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  57.69 
 
 		 565 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  53.97 
 
 		 544 aa  206  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  57.47 
 
 		 566 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  55.75 
 
 		 571 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  52.15 
 
 		 490 aa  192  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  51.28 
 
 		 492 aa  189  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  51.63 
 
 		 585 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  49.47 
 
 		 515 aa  189  2.9999999999999997e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  49.47 
 
 		 515 aa  189  2.9999999999999997e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  49.47 
 
 		 515 aa  189  2.9999999999999997e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  53.89 
 
 		 585 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  51.61 
 
 		 585 aa  187  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  48.92 
 
 		 490 aa  184  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  48.92 
 
 		 490 aa  184  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  48.92 
 
 		 490 aa  184  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  63.12 
 
 		 515 aa  184  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  48.92 
 
 		 490 aa  184  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  48.92 
 
 		 487 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  52.75 
 
 		 569 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  52.81 
 
 		 592 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  52.81 
 
 		 576 aa  180  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  52.81 
 
 		 576 aa  180  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  52.81 
 
 		 576 aa  180  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0846  retron-type reverse transcriptase-like protein  55.75 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  49.42 
 
 		 596 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  44.32 
 
 		 602 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  44.62 
 
 		 635 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  44.62 
 
 		 635 aa  145  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  49.43 
 
 		 648 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  49.43 
 
 		 648 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  46.07 
 
 		 607 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  46.07 
 
 		 607 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  46.07 
 
 		 607 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  46.07 
 
 		 607 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  43.55 
 
 		 554 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.28 
 
 		 661 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 553 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0470  RNA-directed DNA polymerase  45.99 
 
 		 262 aa  134  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  46.02 
 
 		 627 aa  131  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  46.02 
 
 		 627 aa  131  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  42.08 
 
 		 548 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  42.08 
 
 		 548 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  42.08 
 
 		 548 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  42.08 
 
 		 548 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  44.02 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  42.08 
 
 		 548 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  42.08 
 
 		 548 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  40.8 
 
 		 634 aa  125  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1430  SwissProt accession number P19593-like protein  53.33 
 
 		 129 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  0.373599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  39.04 
 
 		 589 aa  111  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.68 
 
 		 502 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3857  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.19 
 
 		 604 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 587 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  42.14 
 
 		 483 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2751  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.34 
 
 		 618 aa  95.5  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  40.3 
 
 		 503 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0025  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  41.73 
 
 		 507 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0016  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  41.73 
 
 		 507 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.934591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>