173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06345 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  100 
 
 
778 aa  1611    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  60.44 
 
 
807 aa  991    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.94 
 
 
797 aa  589  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.1 
 
 
794 aa  545  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.6 
 
 
811 aa  465  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.58 
 
 
683 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.18 
 
 
688 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.62 
 
 
688 aa  329  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.82 
 
 
676 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  35.59 
 
 
795 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  33.24 
 
 
1140 aa  234  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.19 
 
 
785 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.99 
 
 
781 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  36.26 
 
 
777 aa  219  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.14 
 
 
542 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.24 
 
 
775 aa  217  5.9999999999999996e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.16 
 
 
553 aa  214  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.04 
 
 
613 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.15 
 
 
609 aa  210  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.16 
 
 
795 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.03 
 
 
605 aa  208  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.18 
 
 
812 aa  205  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.54 
 
 
790 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.27 
 
 
618 aa  204  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.9 
 
 
762 aa  204  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.67 
 
 
812 aa  204  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  33.6 
 
 
736 aa  204  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.91 
 
 
526 aa  203  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.12 
 
 
821 aa  201  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.69 
 
 
613 aa  201  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.95 
 
 
549 aa  201  6e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.43 
 
 
533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.55 
 
 
772 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.44 
 
 
905 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  31.9 
 
 
776 aa  198  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.94 
 
 
774 aa  197  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.7 
 
 
634 aa  197  8.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.66 
 
 
655 aa  194  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.24 
 
 
779 aa  192  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.67 
 
 
766 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.13 
 
 
636 aa  191  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.96 
 
 
834 aa  190  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.91 
 
 
765 aa  190  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.76 
 
 
665 aa  187  6e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.08 
 
 
779 aa  187  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.48 
 
 
534 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
527 aa  184  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  34.52 
 
 
639 aa  181  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.34 
 
 
636 aa  177  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  33.95 
 
 
637 aa  177  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.31 
 
 
505 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.55 
 
 
618 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.13 
 
 
627 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  32 
 
 
602 aa  173  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.86 
 
 
639 aa  170  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.52 
 
 
760 aa  168  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.34 
 
 
469 aa  167  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.94 
 
 
546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.26 
 
 
547 aa  166  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  29.91 
 
 
639 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.99 
 
 
422 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.06 
 
 
529 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  28.18 
 
 
543 aa  160  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.92 
 
 
545 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.17 
 
 
534 aa  158  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  28.42 
 
 
614 aa  158  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01502  N-acetylglucosaminidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HGI3]  32.41 
 
 
603 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000172563  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  29.61 
 
 
639 aa  157  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.66 
 
 
614 aa  157  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.67 
 
 
515 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.42 
 
 
481 aa  149  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.16 
 
 
525 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.12 
 
 
673 aa  138  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.35 
 
 
549 aa  137  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.92 
 
 
493 aa  136  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.33 
 
 
500 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.45 
 
 
593 aa  134  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.14 
 
 
489 aa  134  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.79 
 
 
584 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49563  predicted protein  31.8 
 
 
973 aa  132  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.13 
 
 
816 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  29.22 
 
 
558 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.4 
 
 
673 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.65 
 
 
504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.64 
 
 
518 aa  128  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.52 
 
 
858 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.8 
 
 
528 aa  124  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.56 
 
 
447 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.69 
 
 
820 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.85 
 
 
525 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.51 
 
 
868 aa  121  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.07 
 
 
628 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.82 
 
 
530 aa  118  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03620  Beta-hexosaminidase precursor, putative  27.01 
 
 
586 aa  115  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.25 
 
 
863 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  26.26 
 
 
889 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  31.28 
 
 
503 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.56 
 
 
853 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.62 
 
 
866 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.06 
 
 
722 aa  109  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>