82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04767 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  748    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  52.11 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  52.11 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  52.11 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  36.93 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  34.47 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  29.33 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  38.62 
 
 		 202 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  38.97 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  38.05 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3404  protein of unknown function DUF218  33.9 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  32.32 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  32 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  34.62 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  34.62 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.77 
 
 		 262 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  29.75 
 
 		 206 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0775  hypothetical protein, putative phage gene  31.16 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.626314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  26.2 
 
 		 280 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  29.23 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  29 
 
 		 178 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  29 
 
 		 185 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  27.22 
 
 		 235 aa  49.7  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  29.09 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  28.67 
 
 		 280 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  24.58 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  28.67 
 
 		 280 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  31.36 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  31.86 
 
 		 212 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.4 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  31.15 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  31.91 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  29.09 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  29.03 
 
 		 192 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  25.99 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  32.63 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  27 
 
 		 185 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  23.23 
 
 		 219 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  28.79 
 
 		 185 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  46.6  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  24.11 
 
 		 210 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  25.89 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  24.11 
 
 		 207 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  26.19 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  28.4 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  27.38 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  34.4 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  27.21 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  32.5 
 
 		 247 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  28.12 
 
 		 209 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  29.17 
 
 		 228 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  31.09 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  32.91 
 
 		 223 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  27.59 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  44.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  26.02 
 
 		 194 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  29.17 
 
 		 215 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  28.12 
 
 		 205 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  29.91 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  27.56 
 
 		 278 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1471  hypothetical protein  29.1 
 
 		 257 aa  43.5  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  26.06 
 
 		 264 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  23.67 
 
 		 264 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  32.14 
 
 		 271 aa  43.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  22.49 
 
 		 264 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  24.16 
 
 		 251 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  27.88 
 
 		 199 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  24.18 
 
 		 212 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  25.71 
 
 		 278 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  28.81 
 
 		 194 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>