156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003755 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003755  predicted signal transduction protein  100 
 
 		 306 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02629  hypothetical protein  90.85 
 
 		 306 aa  581  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0722  hypothetical protein  70.26 
 
 		 311 aa  455  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2035  hypothetical protein  59.42 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  25.96 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  26.91 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  26.91 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  25.88 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  26.01 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  25.81 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  24.05 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  25.78 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  25.1 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  25.56 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  25.33 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 399 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  24.66 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  24.66 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  24.66 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  25.11 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  24.66 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  24.28 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  22.08 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  23.1 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  24.05 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  28.64 
 
 		 430 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  24.65 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  25.31 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  26.63 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  26.34 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 718 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  25.1 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  25.95 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  25.36 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  38.89 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 		 440 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  26.89 
 
 		 716 aa  59.3  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  23.65 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  23.65 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0866  Metal-dependent hydrolase HDOD  34.94 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1128  putative signal transduction protein  33.98 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  25.69 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  27.44 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  24.37 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  23.73 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  24.38 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.21 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  21.5 
 
 		 410 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.73 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  25.41 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  34.44 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2001  HDOD domain-contain protein  34.44 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  24.03 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  22.09 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  24.03 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0600  response regulator  25.5 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  25.21 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  22.81 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  25.29 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  27.84 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  22.03 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2515  putative signal transduction protein  24.89 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  30.85 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  27.39 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  24.27 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  32.14 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  22.94 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  21.1 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  21.1 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 298 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  23.83 
 
 		 297 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  23.48 
 
 		 281 aa  49.3  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.53 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  25.69 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1199  putative signal transduction protein  24.36 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000261595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  22.78 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  30.49 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  29.05 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  22.36 
 
 		 346 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  22.73 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02599  response regulator  36.52 
 
 		 382 aa  46.6  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  24.32 
 
 		 488 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  22.45 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  24.32 
 
 		 488 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2488  putative signal transduction protein  32.53 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  34.18 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>