83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1302 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  56.44 
 
 		 212 aa  238  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  54.19 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  50.75 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  48.24 
 
 		 222 aa  187  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  42.65 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  43.2 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  43.2 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  41.09 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  41.26 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  37.38 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  36.95 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  34.67 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  34.87 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  28.79 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1952  hypothetical protein  28.33 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  26.94 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  26.42 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  34.82 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  26.64 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  27.44 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  27.44 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  27.44 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  27.44 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  27.44 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  27.44 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  27.44 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  27.44 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  28.05 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  26.98 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  29.32 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  31.72 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1516  protein YdcF  26.36 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1760  protein YdcF  26.36 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1820  hypothetical protein  26.36 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1757  hypothetical protein  26.36 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  0.0972712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1699  hypothetical protein  26.36 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  hitchhiker  0.00242518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  29.25 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  30.71 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  30.71 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  27.87 
 
 		 264 aa  52  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  28.97 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  28.8 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01239  DUF218 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01750)  25.74 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  27.46 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  32.23 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  32.23 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  33.86 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  24.34 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  28.35 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  29.29 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  29.19 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  30.83 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  28.76 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  30 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  30 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  24.09 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2200  hypothetical protein  27.59 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  26.79 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  28.28 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  35.05 
 
 		 336 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  29.17 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  35.29 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  25.49 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  28.04 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  27.91 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  29.78 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  32.28 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.28 
 
 		 265 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  34.12 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  34.12 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  34.09 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  29.84 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  26.76 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  26.36 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  26.45 
 
 		 189 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>