More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0367 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  100 
 
 
302 aa  621  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  42.16 
 
 
317 aa  268  8e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  43 
 
 
314 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  41.18 
 
 
317 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  43.69 
 
 
313 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  38.82 
 
 
336 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  38.1 
 
 
299 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  34.77 
 
 
337 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  39.3 
 
 
333 aa  178  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  38.05 
 
 
296 aa  178  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  34.24 
 
 
317 aa  171  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  41.18 
 
 
333 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  35.12 
 
 
300 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  34.78 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  34.47 
 
 
302 aa  162  9e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  31.37 
 
 
293 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  45.68 
 
 
262 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  36.64 
 
 
309 aa  149  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  43.9 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  28.94 
 
 
319 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  30.59 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  47.76 
 
 
286 aa  134  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  34.13 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  39.74 
 
 
233 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  34.47 
 
 
414 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  34.52 
 
 
274 aa  122  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  33.06 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  39.72 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.4 
 
 
312 aa  120  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  36.73 
 
 
300 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  36.23 
 
 
577 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  42.64 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  35.75 
 
 
577 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  39.01 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  40.3 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  30.57 
 
 
377 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  44.26 
 
 
569 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  42.15 
 
 
581 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  39.72 
 
 
464 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  33.8 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  36.62 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  41.41 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  41.41 
 
 
399 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  44.29 
 
 
223 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  41.38 
 
 
524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  41.78 
 
 
247 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  40.6 
 
 
442 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.1 
 
 
321 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  44.74 
 
 
527 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.42 
 
 
343 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  40.15 
 
 
323 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  32.84 
 
 
375 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  39.85 
 
 
301 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  37.87 
 
 
375 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  41.6 
 
 
419 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  33.33 
 
 
374 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  43.97 
 
 
458 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  45.54 
 
 
533 aa  105  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  38.97 
 
 
305 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  39.71 
 
 
447 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  35.59 
 
 
541 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  40.31 
 
 
288 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  38.97 
 
 
305 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  39.71 
 
 
447 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  39.67 
 
 
412 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  28.62 
 
 
308 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  38.97 
 
 
446 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  39.67 
 
 
420 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  39.34 
 
 
400 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  39.39 
 
 
321 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  38.97 
 
 
305 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  39.34 
 
 
425 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  39.34 
 
 
421 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  39.53 
 
 
229 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  32.02 
 
 
309 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  39.34 
 
 
425 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  39.34 
 
 
421 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  38.81 
 
 
442 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  37.42 
 
 
340 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  39.67 
 
 
646 aa  103  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  37.27 
 
 
490 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  38.21 
 
 
314 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  48.28 
 
 
507 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  42.61 
 
 
434 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  38.69 
 
 
387 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  39.84 
 
 
316 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  42.15 
 
 
490 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  37.41 
 
 
419 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  40.98 
 
 
656 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  40.98 
 
 
649 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  41.98 
 
 
384 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  38.52 
 
 
687 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  34.09 
 
 
379 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  32.65 
 
 
377 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  41.8 
 
 
402 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  41.8 
 
 
674 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  32.62 
 
 
412 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  40.5 
 
 
646 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  38.6 
 
 
271 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>