More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0643 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0643  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtB  100 
 
 		 789 aa  1606    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.787041  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2752  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 790 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.296957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 790 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3242  phosphoglycerate transport regulator  34.84 
 
 		 787 aa  439  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  40.82 
 
 		 616 aa  180  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  38.66 
 
 		 617 aa  177  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  37.55 
 
 		 622 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2537  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  40.55 
 
 		 668 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  39.76 
 
 		 667 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2626  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  40.08 
 
 		 668 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2650  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  40.08 
 
 		 668 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2586  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  40.08 
 
 		 668 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0953396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2755  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  40.08 
 
 		 668 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  37.5 
 
 		 623 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  37.25 
 
 		 604 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  37.18 
 
 		 630 aa  165  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  41.47 
 
 		 625 aa  165  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  40.7 
 
 		 625 aa  164  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  37.23 
 
 		 599 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 683 aa  163  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  35.12 
 
 		 594 aa  163  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  38.65 
 
 		 665 aa  161  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 637 aa  161  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  36.5 
 
 		 612 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  36.33 
 
 		 620 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  36.3 
 
 		 666 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 604 aa  160  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  39.18 
 
 		 623 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  37.55 
 
 		 615 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 604 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 635 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 771 aa  158  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  35.94 
 
 		 666 aa  158  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 672 aa  157  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  36.06 
 
 		 600 aa  156  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2129  sensor histidine kinase  36.68 
 
 		 587 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178359  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  37.99 
 
 		 670 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  37.97 
 
 		 659 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 620 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1462  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 600 aa  156  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0277816  normal  0.69414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 668 aa  155  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 622 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  37.08 
 
 		 615 aa  153  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 602 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 628 aa  152  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 672 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 634 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  34.97 
 
 		 669 aa  151  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  37.64 
 
 		 603 aa  150  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 635 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  36.4 
 
 		 669 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 677 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 634 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 630 aa  150  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 669 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 669 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 602 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  34.15 
 
 		 643 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  34.15 
 
 		 643 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  39 
 
 		 635 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 643 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  39.02 
 
 		 588 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  36.25 
 
 		 626 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 634 aa  148  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1230  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  34.15 
 
 		 310 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0439907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  38.95 
 
 		 597 aa  147  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 585 aa  147  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572324  normal  0.76853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  36.33 
 
 		 624 aa  147  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  34.15 
 
 		 322 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 621 aa  147  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  33.45 
 
 		 621 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  39.26 
 
 		 586 aa  147  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  40.17 
 
 		 638 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  37.78 
 
 		 601 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 604 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 603 aa  147  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 606 aa  147  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  35.76 
 
 		 677 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  35.76 
 
 		 677 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  38.35 
 
 		 600 aa  146  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  35.86 
 
 		 621 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  36.82 
 
 		 634 aa  145  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  36.73 
 
 		 604 aa  145  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  38.37 
 
 		 630 aa  145  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  40.17 
 
 		 590 aa  145  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  36.23 
 
 		 635 aa  145  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  36.01 
 
 		 668 aa  144  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1815  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 583 aa  144  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 621 aa  144  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  37.04 
 
 		 604 aa  144  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 627 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 597 aa  143  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0801303  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  36.7 
 
 		 598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.42 
 
 		 677 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  35.82 
 
 		 604 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>