More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2385 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 346 aa  687    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  62.95 
 
 		 349 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.94 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  42.26 
 
 		 347 aa  251  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  40.42 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  39.36 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  44.21 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 335 aa  242  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  43.75 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  43.43 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  40.74 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  37.31 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  38.72 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.86 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  40.84 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.14 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  41.12 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.95 
 
 		 336 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  41.59 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  41.98 
 
 		 343 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2567  transcriptional regulator, LacI family  43.66 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.789697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  42.12 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  40.24 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  38.48 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  39.16 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3259  alanine racemase  42.55 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884845  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  38.46 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  40.65 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  38.77 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3489  LacI family transcription regulator  41.95 
 
 		 338 aa  222  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0487492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  39.88 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  38.99 
 
 		 354 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  38.21 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.28 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  39.77 
 
 		 353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  42.17 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  38.81 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1432  transcriptional regulator, LacI family  43.29 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.61 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  41.27 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  40.95 
 
 		 342 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  40.55 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  40.66 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  37.27 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3964  transcriptional regulator, LacI family  41.46 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147565  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  37.98 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 		 342 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  34.73 
 
 		 333 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  35.26 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  36.97 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  34.95 
 
 		 332 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  36.75 
 
 		 365 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.91 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  38.81 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4647  LacI family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0134194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  39.09 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  36.55 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  31.23 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.83 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  38.99 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3975  transcriptional regulator, LacI family  38.48 
 
 		 329 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00653549  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  36.86 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  33.43 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4950  putative LacI family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213435  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.86 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5883  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.84 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.92391 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1104  periplasmic sugar binding transcriptional regulator  37.69 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  38.91 
 
 		 358 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  29.79 
 
 		 327 aa  202  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  36.75 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  39.53 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.87 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  36.75 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.83 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  36.75 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  36.75 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  36.87 
 
 		 343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  39.14 
 
 		 337 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  36.13 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2074  transcriptional regulator, LacI family  31.53 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  35.82 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  36.58 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  36.58 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  36.58 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.64 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  33.23 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>