86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1807 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1807  signal-transduction protein  100 
 
 
145 aa  290  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1845  signal-transduction protein  80.69 
 
 
145 aa  247  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0324  putative signal transduction protein with CBS domains  37.06 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  25.17 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  30.66 
 
 
427 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  24.66 
 
 
427 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  29.25 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 
428 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  25.52 
 
 
423 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  29.46 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  30.53 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  28.89 
 
 
426 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  27.48 
 
 
223 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  31.4 
 
 
166 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.79 
 
 
490 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  27.33 
 
 
227 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  29.84 
 
 
688 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  29.37 
 
 
210 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  29.2 
 
 
222 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  33.73 
 
 
249 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  26.77 
 
 
287 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.77 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  27 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.03 
 
 
688 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  25.33 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  51.43 
 
 
230 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 
279 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  26.45 
 
 
171 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  38.46 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
496 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.18 
 
 
482 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
496 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
496 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.18 
 
 
482 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0833  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
251 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  26.17 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  34.43 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.51 
 
 
483 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.19 
 
 
598 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  34.33 
 
 
483 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.69 
 
 
504 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_820  CBS domain protein  29.2 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  27.01 
 
 
380 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0949  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  21.19 
 
 
152 aa  42  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  31.69 
 
 
150 aa  42  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.88 
 
 
482 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0498  hypothetical protein  26.15 
 
 
207 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  26.5 
 
 
386 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12710  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.26 
 
 
210 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  43.14 
 
 
256 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  27.66 
 
 
149 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  33.77 
 
 
150 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  27.54 
 
 
144 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  28.77 
 
 
590 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  25.69 
 
 
222 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
688 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  35.42 
 
 
537 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 
431 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  25.96 
 
 
211 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.88 
 
 
482 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  35.29 
 
 
291 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  34.21 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  28.19 
 
 
417 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  37.04 
 
 
226 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0276  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.14 
 
 
482 aa  40.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.81 
 
 
497 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  26.17 
 
 
689 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  32.73 
 
 
513 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.94 
 
 
483 aa  40.8  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.94 
 
 
497 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  29.58 
 
 
483 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 
149 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  25.83 
 
 
155 aa  40  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.03 
 
 
591 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  28.21 
 
 
218 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>