More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0408 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 582 aa  699    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  97.05 
 
 		 577 aa  1157    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  66.49 
 
 		 574 aa  794    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  67.4 
 
 		 564 aa  780    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 577 aa  1184    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 		 574 aa  632  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 570 aa  616  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  55.68 
 
 		 564 aa  618  1e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 567 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 566 aa  609  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 585 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 572 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 567 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 573 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 569 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 566 aa  598  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 573 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 571 aa  599  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 572 aa  600  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 566 aa  597  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 566 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 566 aa  598  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 566 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 566 aa  597  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 566 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 566 aa  595  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 566 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 573 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 566 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 566 aa  597  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 570 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 570 aa  591  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 575 aa  585  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 570 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 576 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 572 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 578 aa  578  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 570 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 576 aa  568  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 571 aa  565  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 580 aa  566  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 565 aa  558  1e-158  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 574 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 579 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 575 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 574 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 568 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 574 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 573 aa  556  1e-157  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 569 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 567 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 567 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10860  prolyl-tRNA synthetase, family II  50.52 
 
 		 588 aa  545  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  50.62 
 
 		 570 aa  545  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 569 aa  548  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 569 aa  543  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 567 aa  545  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 569 aa  542  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0808  prolyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 565 aa  544  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000617993  hitchhiker  0.000236746 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 569 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 574 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0748  prolyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 572 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 584 aa  539  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 578 aa  535  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 571 aa  534  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 576 aa  532  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 570 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 569 aa  531  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 574 aa  523  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 573 aa  522  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0714  prolyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 565 aa  522  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 571 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 571 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 579 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 571 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2498  prolyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 590 aa  520  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.83332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 582 aa  519  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 568 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 572 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 572 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 577 aa  517  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 574 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 571 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 571 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 571 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 571 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 569 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 572 aa  512  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 577 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 572 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 572 aa  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 572 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>