More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0862 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  100 
 
 
441 aa  882    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  59.59 
 
 
451 aa  529  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  58.45 
 
 
450 aa  527  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  58.45 
 
 
451 aa  525  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  58.86 
 
 
450 aa  521  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  56.92 
 
 
456 aa  513  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  58.18 
 
 
452 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  54.28 
 
 
448 aa  467  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  56.26 
 
 
452 aa  468  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.739423 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  45.33 
 
 
463 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  47.42 
 
 
458 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  44.39 
 
 
484 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  42.92 
 
 
468 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  43.58 
 
 
484 aa  374  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  44.52 
 
 
485 aa  372  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  43.31 
 
 
455 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  42.5 
 
 
462 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  45.35 
 
 
459 aa  370  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  41.67 
 
 
451 aa  352  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  47.22 
 
 
642 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.86 
 
 
644 aa  50.8  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  45.83 
 
 
639 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  45.83 
 
 
640 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  45.83 
 
 
640 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  45.83 
 
 
638 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  44.59 
 
 
637 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.24 
 
 
608 aa  49.7  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  44.59 
 
 
637 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  44.59 
 
 
637 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  39.24 
 
 
499 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.24 
 
 
604 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.46 
 
 
616 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.24 
 
 
643 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.43 
 
 
651 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  44.44 
 
 
637 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  54.35 
 
 
615 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 
577 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.43 
 
 
640 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  63.16 
 
 
632 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.25 
 
 
621 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 
607 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.25 
 
 
621 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.97 
 
 
638 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  45.16 
 
 
775 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86369  member of the AAA ATPase family of proteins  36.78 
 
 
810 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.435802 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  43.24 
 
 
637 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  53.06 
 
 
639 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3640  Lon-A peptidase  46.77 
 
 
812 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0005782  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 
656 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.53 
 
 
640 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 
701 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.53 
 
 
640 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  41.67 
 
 
632 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  43.06 
 
 
628 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.06 
 
 
628 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2733  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.51 
 
 
671 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.622725  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.57 
 
 
662 aa  47  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.06 
 
 
628 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.29 
 
 
618 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.24 
 
 
615 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  60.53 
 
 
667 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.53 
 
 
645 aa  47  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0514  AAA ATPase central domain protein  41.38 
 
 
657 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33501  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  39.76 
 
 
805 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.53 
 
 
631 aa  47  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  41.67 
 
 
630 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.33 
 
 
731 aa  47  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  39.76 
 
 
805 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
616 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.25 
 
 
631 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.06 
 
 
623 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.53 
 
 
660 aa  47  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  57.89 
 
 
617 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.25 
 
 
629 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  60.53 
 
 
645 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  60.53 
 
 
628 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  37.25 
 
 
632 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  51.06 
 
 
599 aa  46.6  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46568  predicted protein  41.54 
 
 
821 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.927409  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.25 
 
 
638 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.25 
 
 
628 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  57.89 
 
 
617 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.26 
 
 
697 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  60.53 
 
 
630 aa  46.6  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.9 
 
 
505 aa  46.6  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.547641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  42.47 
 
 
350 aa  47  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.25 
 
 
640 aa  47  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.25 
 
 
629 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  41.25 
 
 
641 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
628 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.33 
 
 
731 aa  47  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  57.89 
 
 
617 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.17 
 
 
601 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.17 
 
 
601 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.26 
 
 
697 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  57.89 
 
 
613 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.25 
 
 
631 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.25 
 
 
628 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.25 
 
 
631 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
627 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>