34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0445 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  100 
 
 
604 aa  1200    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  29.74 
 
 
590 aa  248  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  22.65 
 
 
615 aa  127  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0195  Type II secretion system F domain protein  25.1 
 
 
616 aa  127  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  20.83 
 
 
716 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  23.99 
 
 
658 aa  91.7  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  25.54 
 
 
328 aa  88.2  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  22.66 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  19.42 
 
 
644 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  21.29 
 
 
652 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  25.75 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  26.34 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  25.5 
 
 
296 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  21.54 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  25.43 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  24.64 
 
 
647 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  23.32 
 
 
332 aa  64.3  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  18.82 
 
 
678 aa  63.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  21.47 
 
 
582 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  20 
 
 
300 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  24.1 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  21.4 
 
 
625 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  24.37 
 
 
284 aa  58.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  20.91 
 
 
329 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  19.06 
 
 
625 aa  56.2  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  21.57 
 
 
306 aa  54.7  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  20.86 
 
 
601 aa  54.7  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  20.41 
 
 
641 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  17.77 
 
 
807 aa  51.2  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  26.24 
 
 
578 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  20.43 
 
 
802 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  20.19 
 
 
536 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  23.97 
 
 
290 aa  46.2  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  21.98 
 
 
684 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>