More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0103 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0103  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 		 634 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 651 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 664 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 629 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 629 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 628 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  60.61 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 710 aa  114  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1156  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  60.42 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  58.59 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 		 669 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 648 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 654 aa  110  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 653 aa  110  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 682 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 653 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 634 aa  106  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 662 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 650 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 663 aa  104  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0655  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.54 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1320  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.91 
 
 		 108 aa  103  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000452217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 690 aa  102  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 673 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 693 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 632 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 671 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 660 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 663 aa  101  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 660 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 660 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 672 aa  101  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 660 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 660 aa  100  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 660 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 660 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 660 aa  100  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 660 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 659 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 705 aa  100  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 645 aa  100  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 647 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1689  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.44 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 647 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 711 aa  99.4  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 656 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 663 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 657 aa  98.6  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 657 aa  98.6  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 660 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 663 aa  98.2  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 680 aa  98.2  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 663 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 702 aa  98.2  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.43 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0597  tRNA-binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 655 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 645 aa  96.7  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 650 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 691 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 699 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 664 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 645 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 636 aa  95.9  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 628 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 684 aa  95.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 702 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  43.14 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 632 aa  94.7  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 642 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 645 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 663 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 688 aa  94  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 636 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 697 aa  93.6  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 638 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 731 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 657 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 640 aa  92  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 702 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 704 aa  91.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 648 aa  90.5  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 648 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 680 aa  90.1  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2941  methionyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 670 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 670 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 642 aa  90.1  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 674 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 675 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 654 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 690 aa  88.2  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 642 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 644 aa  88.2  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1936  methionyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 728 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 686 aa  87.8  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 698 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 651 aa  87.8  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 675 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 629 aa  87  7e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>