174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3262 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  100 
 
 		 143 aa  268  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  44.37 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1441  DoxX family protein  48.09 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0421253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  59.26 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  38.1 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  43.08 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  39.84 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  40.43 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  41.91 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  44.9 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  43.44 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  38.58 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  44.66 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  38.41 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  49.47 
 
 		 216 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  42.28 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  38.02 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  38.28 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  36.73 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  39.34 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  39.62 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  37.5 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  38.02 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  37.5 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  37.1 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  36.43 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  42.39 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  45.65 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  42.97 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  36.15 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  39.82 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.36 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  34.35 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  42.19 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  38.66 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  34.75 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  38.64 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  37.93 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  33.77 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  38.3 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  40.37 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  40.37 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  39.83 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  28.68 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  39.78 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  31.06 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  42.06 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  44.44 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  36.79 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  36.8 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  40.91 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  40.91 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  45.54 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  43.56 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  48.72 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  32.26 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  33.64 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  38.89 
 
 		 198 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  38.3 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  39.45 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  41.12 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  27.64 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  47.44 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  32.09 
 
 		 180 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  38.39 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  32.09 
 
 		 180 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  32.09 
 
 		 180 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  35.21 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  35.21 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  35.92 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  32.87 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  33.1 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  38.04 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  38.46 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  35.21 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  44.55 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  38.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  38.04 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  38.46 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  49.15 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  49.15 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  49.15 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  35.92 
 
 		 133 aa  48.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  37.04 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  49.09 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  35.88 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  38.78 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  33.1 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  36 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  37.3 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  35.2 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  36.96 
 
 		 204 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  35.2 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  47 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  38.1 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  39.62 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  38.75 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  31.82 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  38.1 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  38.3 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>