More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1967 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1967  ABC transporter related protein  100 
 
 		 220 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.234063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0115  ABC transporter related  52.43 
 
 		 208 aa  197  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4496  ABC transporter related protein  55.15 
 
 		 204 aa  191  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  46.19 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3241  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.05 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.347977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  35.11 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03970  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  43.48 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.153637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  33 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  41.31 
 
 		 566 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  32.83 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3035  ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  36.32 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  36.17 
 
 		 205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0191  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.29 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 		 326 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  33.5 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2398  ABC transporter related  39.22 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.39 
 
 		 566 aa  112  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0845  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.02 
 
 		 358 aa  112  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.692378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2514  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.57 
 
 		 406 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  32.98 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  37.5 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3070  ABC transporter related  39.18 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.024747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0915  oligopeptide ABC transporter ATPase  34.26 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  34.74 
 
 		 575 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  32.7 
 
 		 593 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  32.74 
 
 		 601 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 		 332 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 593 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  34.39 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1280  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  31.94 
 
 		 552 aa  108  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  42.36 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2116  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.29 
 
 		 333 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492101  normal  0.0207459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.95 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84761  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.73 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3547  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.63 
 
 		 426 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877618  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  32.98 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1846  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.81 
 
 		 450 aa  105  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.231668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  34.63 
 
 		 531 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1055  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  34.11 
 
 		 560 aa  105  6e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.573369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  38.05 
 
 		 597 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  38.66 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.35 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4554  ABC transporter related  37.07 
 
 		 670 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  28.9 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.55 
 
 		 337 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2086  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.22 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.787824  normal  0.913177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2801  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.18 
 
 		 334 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0725461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  31.51 
 
 		 337 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3490  ABC transporter related  37.04 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2028  ABC transporter, ATP-binding protein  31.38 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.97327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.73 
 
 		 564 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  38.12 
 
 		 536 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  32.77 
 
 		 603 aa  102  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0453  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.84 
 
 		 336 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.219882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  39.79 
 
 		 518 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1763  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 		 333 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5788  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  32.18 
 
 		 545 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1297  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.78 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  33.5 
 
 		 559 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  33.5 
 
 		 559 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  34.91 
 
 		 246 aa  101  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2644  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.79 
 
 		 322 aa  101  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.277235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0185  ABC transporter related  39.47 
 
 		 268 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3117  ABC type ATPase  37.86 
 
 		 331 aa  101  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0682716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5910  peptide ABC transporter ATP-binding protein  33.68 
 
 		 339 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0678087  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  31.22 
 
 		 543 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3421  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.78 
 
 		 369 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0906  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  33.51 
 
 		 330 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0105903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  34.91 
 
 		 366 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  33.16 
 
 		 572 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0537  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.49 
 
 		 444 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4408  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.05 
 
 		 333 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.98 
 
 		 355 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0418  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 323 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0835793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3819  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.54 
 
 		 336 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51970  ATP binding protein of ABC transporter  35.71 
 
 		 465 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00174375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2392  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.54 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.066682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  34.39 
 
 		 368 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 		 571 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.99 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  37 
 
 		 624 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  34.98 
 
 		 557 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0857  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.94 
 
 		 558 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3841  nickel transporter ATP-binding protein NikE  32.88 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0235  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.74 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.99 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0219399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2299  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.21 
 
 		 391 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000220082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2298  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.13 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.21 
 
 		 352 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00715286  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03329  nickel transporter subunit  32.88 
 
 		 268 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3964  nickel transporter ATP-binding protein NikE  32.88 
 
 		 268 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0236  nickel transporter ATP-binding protein NikE  32.88 
 
 		 268 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4820  nickel transporter ATP-binding protein NikE  32.88 
 
 		 268 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3679  nickel transporter ATP-binding protein NikE  32.88 
 
 		 268 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  34.13 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>