More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3248 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 255 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  60.87 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  56.69 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  55.56 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  51.59 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  50.79 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  48.03 
 
 		 259 aa  218  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  45.88 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  51.39 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  48.71 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  45.14 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  46.25 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  49 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  48.08 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  44.71 
 
 		 258 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  45.82 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  44.31 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  44.02 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  43.72 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  45.34 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  43.8 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  44.13 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  41.96 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  43.48 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  44.06 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  47.04 
 
 		 288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  48.28 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  40.86 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  41.09 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  44.98 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  43.07 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  42.46 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  41.67 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  39.69 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  44.13 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  44.13 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  44.13 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  44.13 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  44.13 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  40.73 
 
 		 256 aa  184  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 262 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  37.4 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  43.72 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  43.72 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 272 aa  181  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  43.82 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  43.96 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  41.11 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  45.83 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  44.09 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  45.45 
 
 		 281 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  44.09 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  43.87 
 
 		 283 aa  178  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  38.13 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  40.47 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  41.09 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  41.09 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  41.09 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  40.08 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  38.98 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  43.95 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  41.86 
 
 		 271 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  40.47 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  39.37 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  40.48 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  40.08 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  41.5 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  41.5 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  41.5 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  39.69 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  41.5 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  40.08 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  45.17 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  38 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  43.18 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  41.5 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  38.49 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  38.82 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  38.82 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  39.69 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  38.52 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  36.8 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  47.96 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  43.95 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  38.91 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  36.86 
 
 		 267 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  40.44 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  40.55 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  39.77 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  42.15 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2017  TatD-related deoxyribonuclease  50.2 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2387  hydrolase, TatD family  50.2 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  38.22 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>