228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3030 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 156 aa  297  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  49.31 
 
 		 208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  57.02 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  49.18 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  60.87 
 
 		 167 aa  90.9  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  51.72 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  46.09 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  51.55 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  50.52 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  46.53 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  50.56 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  45.92 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  48.05 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  49.35 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17591  hypothetical protein  32.71 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.212024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  38.46 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  39.66 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  38.39 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  44.87 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  43 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  43 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  35.66 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  39.47 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  35 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  35.14 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  52.5 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  36.94 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1099  crcB protein  36.36 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.236283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  32.46 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  37.84 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  30.95 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  30.95 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  37.61 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.82 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  35.51 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  35.51 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5763  Camphor resistance CrcB protein  44.44 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  36.7 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  34.51 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  38.71 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  42.11 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  34.21 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 		 125 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  36.47 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  34.29 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 		 132 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  34.51 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  35.66 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  32.2 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  31.9 
 
 		 126 aa  51.2  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  42.42 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  36.9 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  33.91 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  40.48 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  36.56 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  39.51 
 
 		 113 aa  50.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  31.48 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  34.78 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  40.79 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  32.11 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5014  Camphor resistance CrcB protein  50 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  36.73 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  37.4 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  25.93 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  32.48 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  39.22 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  36.84 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  32.11 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  32.35 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  34.78 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  32.11 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  34.52 
 
 		 130 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  35.51 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  31.03 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 		 124 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  34.52 
 
 		 130 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  35.51 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>