102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1437 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  100 
 
 		 313 aa  626  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  66.33 
 
 		 305 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  65.37 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  69.73 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  64.9 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  69.17 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  58.3 
 
 		 281 aa  312  4.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  58.63 
 
 		 293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  63.91 
 
 		 286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  59.52 
 
 		 283 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  62.45 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  66.95 
 
 		 295 aa  295  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  54.76 
 
 		 291 aa  295  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  53.41 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  52.36 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  52.71 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.32 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  55.39 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  58.47 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  61.37 
 
 		 310 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  54 
 
 		 281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  57.2 
 
 		 289 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  56 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  55.28 
 
 		 280 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  52.08 
 
 		 300 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  53.73 
 
 		 306 aa  278  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  59.68 
 
 		 319 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  53.51 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  56.28 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  51 
 
 		 281 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  49.8 
 
 		 288 aa  271  8.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  51.96 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  49.27 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  50.51 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  49.19 
 
 		 280 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.6 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  50.6 
 
 		 281 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.6 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  50.6 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.6 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  48.13 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  50.6 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  50.6 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  50.6 
 
 		 281 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  50.2 
 
 		 281 aa  261  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  39.47 
 
 		 352 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  46.49 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  46.3 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  45.93 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.06 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  39.93 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  41.18 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  65.41 
 
 		 132 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  38.34 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  26.59 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.38 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  24.49 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  26.09 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  25 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  25.15 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.59 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.18 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  25.85 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.67 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.58 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  24.66 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  24.6 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  28.97 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  24.6 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  23.08 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  27.54 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  25.13 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  26.92 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  28.57 
 
 		 361 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  25.51 
 
 		 361 aa  46.2  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.27 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  23.95 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  26.38 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  27.11 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  25.13 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.74 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  28.15 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  28.06 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  26.92 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  25.13 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  27.22 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  25.77 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  27.52 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  26.46 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  24.46 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  21.3 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  20.22 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  26.88 
 
 		 251 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  23.6 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5669  Band 7 protein  25.88 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.95 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  25.29 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  24.73 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  24.73 
 
 		 392 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2756  band 7 protein  23.08 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>