151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0529 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  100 
 
 
86 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  68.6 
 
 
86 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  67.47 
 
 
94 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  67.07 
 
 
86 aa  122  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  67.9 
 
 
93 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  70.67 
 
 
80 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  69.33 
 
 
80 aa  120  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  67.11 
 
 
83 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  70.67 
 
 
78 aa  116  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  69.62 
 
 
82 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  69.62 
 
 
82 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  69.62 
 
 
82 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  66.25 
 
 
82 aa  114  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  62.82 
 
 
92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  65.82 
 
 
81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  65.79 
 
 
88 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 
79 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  68.92 
 
 
82 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  61.73 
 
 
94 aa  110  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  62.16 
 
 
91 aa  110  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  60.26 
 
 
89 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  66.23 
 
 
83 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  59.26 
 
 
87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  64.47 
 
 
83 aa  107  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  60.53 
 
 
79 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  63.16 
 
 
85 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  61.84 
 
 
85 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  63.16 
 
 
84 aa  100  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  66.23 
 
 
84 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  58.9 
 
 
79 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  49.35 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  48 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  48.61 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  36.25 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  53.45 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  40 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  38.75 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  42.47 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  38.16 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  42.86 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  37.35 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  37.5 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  36.49 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  33.33 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  36.67 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  47.37 
 
 
142 aa  53.9  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  42.11 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  38.71 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  34.15 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  36.84 
 
 
86 aa  52  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  38.98 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  39.71 
 
 
229 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  32.18 
 
 
97 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  37.29 
 
 
85 aa  50.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  48.72 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  36.84 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  40 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  42.62 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  36.84 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  35.59 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  36.21 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  37.5 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  40.32 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  35 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  31.08 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2081  glutaredoxin  33.93 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  34.38 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  34.38 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  37.7 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  31.67 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  36.36 
 
 
83 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
85 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  40 
 
 
83 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  48.78 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  31.51 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  32 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  34.48 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  37.04 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  43.59 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  43.75 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  40 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  30.51 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  35 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  29.82 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  35 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  28.33 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  40 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  31.03 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2973  glutaredoxin  43.59 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.64594  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  35.19 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  35.09 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  40.98 
 
 
82 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  40.98 
 
 
82 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  40.98 
 
 
82 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  33.87 
 
 
94 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01340  glutathione transferase, putative  32.14 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  34.43 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  30.65 
 
 
85 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>