204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0046 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0046  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1239    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4565  glycoside hydrolase 15-related protein  50.59 
 
 		 623 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  38.29 
 
 		 599 aa  359  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  38.17 
 
 		 612 aa  347  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  37.11 
 
 		 613 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  37.36 
 
 		 679 aa  337  5e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  35.49 
 
 		 619 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  36.54 
 
 		 613 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  36.65 
 
 		 594 aa  331  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  36.77 
 
 		 645 aa  330  4e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  35.85 
 
 		 586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  35.89 
 
 		 611 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  36.82 
 
 		 594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  35.08 
 
 		 617 aa  326  8.000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  35.46 
 
 		 626 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  36.41 
 
 		 612 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  37.18 
 
 		 636 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  36.38 
 
 		 617 aa  324  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  36.04 
 
 		 596 aa  323  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  35.73 
 
 		 623 aa  323  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  35.1 
 
 		 609 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  35.85 
 
 		 598 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  35.48 
 
 		 609 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  35.32 
 
 		 609 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  36.39 
 
 		 600 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  34.93 
 
 		 625 aa  321  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  35.05 
 
 		 599 aa  321  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  34.99 
 
 		 611 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  35.03 
 
 		 626 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  35.75 
 
 		 665 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  35.67 
 
 		 668 aa  319  9e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  35.36 
 
 		 623 aa  319  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  36.63 
 
 		 597 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  36.25 
 
 		 619 aa  317  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  37.29 
 
 		 599 aa  317  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  34.63 
 
 		 610 aa  317  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  34.82 
 
 		 609 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  34.82 
 
 		 609 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  35.35 
 
 		 672 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  34.25 
 
 		 612 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  37.5 
 
 		 635 aa  314  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  34.65 
 
 		 609 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  35.31 
 
 		 629 aa  313  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  34.87 
 
 		 677 aa  313  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  36.45 
 
 		 602 aa  312  9e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  34.87 
 
 		 677 aa  313  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  35.08 
 
 		 610 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  35.08 
 
 		 610 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  35.08 
 
 		 610 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  35.08 
 
 		 610 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  35.08 
 
 		 610 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  35.08 
 
 		 610 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  35.08 
 
 		 610 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  34.39 
 
 		 594 aa  312  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  34.78 
 
 		 596 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  34.87 
 
 		 677 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  37.29 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  34.21 
 
 		 593 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  36.99 
 
 		 596 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  34.94 
 
 		 600 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  35.51 
 
 		 642 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  35.05 
 
 		 605 aa  309  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  35.02 
 
 		 611 aa  309  8e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  36.47 
 
 		 596 aa  309  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0980  glycoside hydrolase 15-related  36.89 
 
 		 598 aa  309  9e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  34.25 
 
 		 608 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  36.3 
 
 		 629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  34.84 
 
 		 595 aa  307  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  34.32 
 
 		 601 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  35.03 
 
 		 610 aa  308  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 605 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  33.83 
 
 		 609 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  34.42 
 
 		 614 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  35.71 
 
 		 636 aa  305  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  35.49 
 
 		 613 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1092  glycoside hydrolase 15-related  35.68 
 
 		 598 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.281336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  34.44 
 
 		 619 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  35.56 
 
 		 616 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 		 608 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  34.44 
 
 		 619 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  36.72 
 
 		 617 aa  303  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  36.02 
 
 		 617 aa  303  9e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  35.32 
 
 		 628 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  34.78 
 
 		 629 aa  302  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  36.66 
 
 		 659 aa  301  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  35.12 
 
 		 662 aa  300  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  31.49 
 
 		 606 aa  299  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  35.56 
 
 		 601 aa  299  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  36.54 
 
 		 602 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  34.57 
 
 		 602 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 597 aa  299  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  35.33 
 
 		 589 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  33.17 
 
 		 608 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  33.76 
 
 		 598 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  33.94 
 
 		 602 aa  297  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  35.18 
 
 		 623 aa  296  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  36.45 
 
 		 639 aa  296  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  34.38 
 
 		 620 aa  296  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  35.94 
 
 		 602 aa  296  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  35.4 
 
 		 605 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>