More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0644 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0644  RNA polymerase sigma factor SigY  100 
 
 
176 aa  361  4e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1702  RNA polymerase sigma factor SigY  52.27 
 
 
183 aa  200  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0132  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.98 
 
 
194 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000156135  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0843  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.33 
 
 
223 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000467073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3171  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1007  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.09 
 
 
199 aa  97.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35525  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1003  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.09 
 
 
199 aa  97.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0890  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.84 
 
 
220 aa  98.2  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0150  RNA polymerase sigma factor SigW  32.78 
 
 
190 aa  97.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3742  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.89 
 
 
188 aa  97.8  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00162428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0834  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.09 
 
 
199 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0154  RNA polymerase sigma factor SigW  32.6 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000564665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2095  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.33 
 
 
198 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1723  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.02 
 
 
199 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1078  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.09 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478507  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2906  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.09 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419523  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0536  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.02 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.543409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2901  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.02 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1796  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.02 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7113  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0856  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.97 
 
 
205 aa  95.5  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380767  normal  0.0292756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1000  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.97 
 
 
205 aa  95.5  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000231343  normal  0.0259336 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2786  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.02 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2473  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.02 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2808  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.02 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1467  RNA polymerase sigma factor AlgU  29.38 
 
 
193 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000401501  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2177  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.55 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242833 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1085  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.55 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4239  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.55 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0647  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.55 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03772  putative RNA polymerase sigma factor  29.41 
 
 
203 aa  95.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1127  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.55 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2848  RNA polymerase sigma factor RpoE  29.83 
 
 
392 aa  94.4  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4294  RNA polymerase sigma factor AlgU  29.38 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.55493  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1427  RNA polymerase sigma factor AlgU  29.38 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4380  RNA polymerase sigma factor AlgU  29.38 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4757  RNA polymerase sigma factor AlgU  30.51 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1362  RNA polymerase sigma factor AlgU  29.44 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00625661  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54430  RNA polymerase sigma factor AlgU  30.51 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000031272  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1067  RNA polymerase sigma factor AlgU  29.38 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0360661  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3504  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.18 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal  0.884128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4146  sigma-24 (FecI-like)  32.93 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4155  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.11 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00426853  hitchhiker  0.000149569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4706  RNA polymerase sigma factor  31.62 
 
 
181 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1438  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.15 
 
 
206 aa  92.4  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.389052  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2259  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.48 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033618  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2773  RNA polymerase sigma factor  32.41 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4030  RNA polymerase sigma factor  32.35 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.193201 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1369  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.15 
 
 
206 aa  92.4  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0484883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2981  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.9 
 
 
206 aa  92  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000395274  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1115  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.21 
 
 
208 aa  91.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.37407  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1394  RNA polymerase sigma-E factor  31.21 
 
 
208 aa  91.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2486  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.54 
 
 
202 aa  91.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4364  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.53 
 
 
217 aa  91.3  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2022  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.91 
 
 
199 aa  91.3  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000162889  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2425  RNA polymerase sigma factor RpoE  29.95 
 
 
199 aa  91.3  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0205284  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1386  RNA polymerase sigma factor  31.62 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3572  RNA polymerase sigma factor  31.29 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2077  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.91 
 
 
197 aa  91.3  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2662  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.71 
 
 
172 aa  90.9  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.81941e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0395  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.21 
 
 
195 aa  90.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2068  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.93 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.903797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1366  RNA polymerase sigma factor  31.62 
 
 
181 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0719  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.92 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3958  RNA polymerase sigma factor AlgU  29.44 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0486119  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2263  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.65 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.228052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2772  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  34.42 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4224  RNA polymerase sigma-24 factor  29.44 
 
 
193 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002491  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.46 
 
 
192 aa  89  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.012541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1746  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.22 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.30228  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0985  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.48 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664585  normal  0.0675077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1379  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.14 
 
 
237 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1605  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.87 
 
 
191 aa  89  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2125  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.87 
 
 
205 aa  89  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.726167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0920  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.48 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.776822  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1413  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.14 
 
 
237 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491366  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1397  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.14 
 
 
237 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0562007  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1626  RNA polymerase sigma factor AlgU  29.65 
 
 
201 aa  88.6  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2956  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.3 
 
 
190 aa  88.6  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.465971  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1471  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.37 
 
 
190 aa  88.6  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133791  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1810  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.36 
 
 
250 aa  88.2  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.816651  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1220  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.1 
 
 
167 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0980579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09490  RNA polymerase, sigma subunit, ECF family  30.77 
 
 
213 aa  88.2  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.198222  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1706  sigma-70 region 2 domain-containing protein  33.12 
 
 
217 aa  88.2  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3576  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  29.45 
 
 
213 aa  87.8  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2252  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  29.28 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1237  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.34 
 
 
192 aa  87.8  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000109114  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1098  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.56 
 
 
216 aa  87.8  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0618642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2791  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.9 
 
 
191 aa  87.8  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00850329  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2492  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.1 
 
 
270 aa  87.8  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.595064  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01711  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.74 
 
 
206 aa  87.8  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0763  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30 
 
 
177 aa  87.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.061264  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03542  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.46 
 
 
192 aa  87.8  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2634  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 
177 aa  87.4  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530594  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2466  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.82 
 
 
192 aa  87.4  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0040  RNA polymerase sigma factor RpoE  29.55 
 
 
194 aa  87.4  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1433  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.21 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.735901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2606  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.81 
 
 
234 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1142  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.9 
 
 
192 aa  87  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000720782  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3727  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.55 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2415  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.21 
 
 
222 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.752744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>