211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4761 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4761  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 391 aa  794    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617283  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1065  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 373 aa  195  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  29.7 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  25.28 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  23.73 
 
 		 662 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  24.08 
 
 		 543 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  31.71 
 
 		 627 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  30.81 
 
 		 627 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  30.81 
 
 		 627 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  27.04 
 
 		 633 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  24.44 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  32.74 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  33.63 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  37.63 
 
 		 624 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  23.55 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  22.25 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  22.62 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  26.81 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  25.67 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  23.12 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  22.87 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  20.81 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  20.52 
 
 		 433 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  23.73 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  23.98 
 
 		 614 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  24.77 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  20.17 
 
 		 431 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  21.39 
 
 		 362 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  25.32 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 		 280 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  23.15 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  33.08 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  33.08 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  33.08 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  22.54 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  24.27 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  22.51 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  21.43 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  22.16 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  24.9 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 866 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 		 860 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  27.33 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  33.94 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.94 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  39.56 
 
 		 293 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  33.94 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.94 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.94 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  28.66 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  39.56 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  39.56 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  39.56 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  39.56 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  33.94 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  25.27 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  39.56 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  25.27 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  25.27 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  25.27 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  24.81 
 
 		 287 aa  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  25.27 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  24.07 
 
 		 378 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 283 aa  49.7  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  38.46 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  23.3 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  38.46 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  22.7 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  28.66 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  28.66 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2560  small-conductance mechanosensitive channel-like  22.12 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.66 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  23.49 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  28.66 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>