More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3990 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  100 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  56.76 
 
 		 124 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  57.8 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  53.64 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 121 aa  135  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  54.13 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  51.38 
 
 		 125 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  44.04 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  41.53 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  43.64 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  45.28 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  41.28 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  41.82 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 120 aa  103  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 122 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 122 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  40 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.82 
 
 		 322 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  38.74 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  36.75 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 230 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 230 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 230 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  39.64 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  38.74 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.52 
 
 		 310 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 231 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.45 
 
 		 317 aa  94  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 407 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 232 aa  93.6  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 231 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  34.65 
 
 		 240 aa  93.2  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0674  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0682036 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  36.51 
 
 		 385 aa  92  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  41.82 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2286  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 263 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000997036 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 231 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  36.61 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  40.91 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 229 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 229 aa  90.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  36.36 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  34.23 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 248 aa  91.3  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 161 aa  90.5  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 223 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 223 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 235 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  36.52 
 
 		 235 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5910  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 168 aa  90.5  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 235 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1527  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 257 aa  90.5  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  36.52 
 
 		 235 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  40.17 
 
 		 223 aa  90.1  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  40.17 
 
 		 223 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  36.52 
 
 		 235 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  36.52 
 
 		 235 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>