More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5910 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5910  response regulator receiver protein  100 
 
 		 168 aa  339  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1134  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461969  hitchhiker  0.00297359 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1095  response regulator receiver domain-containing protein  63.79 
 
 		 138 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1155  response regulator receiver protein  63.79 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1223  response regulator receiver protein  63.79 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2393  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  47.37 
 
 		 518 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  0.0787545 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  42.11 
 
 		 303 aa  97.1  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 297 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 306 aa  95.5  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 		 1131 aa  93.6  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.05 
 
 		 310 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 407 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.69 
 
 		 226 aa  92  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 306 aa  92.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 246 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 121 aa  91.7  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.8 
 
 		 308 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  40.32 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  39.29 
 
 		 312 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 231 aa  91.7  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 301 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 440 aa  91.7  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 301 aa  91.3  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 231 aa  90.9  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 436 aa  90.9  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 302 aa  90.5  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 231 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 237 aa  90.1  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 123 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.18 
 
 		 305 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  38.06 
 
 		 1278 aa  89.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.89 
 
 		 396 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 440 aa  89.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.07 
 
 		 337 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5514  two component LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 305 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0978  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.15 
 
 		 322 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97362  decreased coverage  0.00116316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 234 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 225 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 236 aa  89  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 		 246 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 123 aa  88.6  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 		 240 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 304 aa  88.6  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  38.05 
 
 		 277 aa  88.2  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 229 aa  88.2  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 305 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  36.36 
 
 		 1987 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.36 
 
 		 1992 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 232 aa  87.8  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  39.25 
 
 		 734 aa  87.8  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  37.93 
 
 		 256 aa  87.8  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 231 aa  87.4  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  35 
 
 		 227 aa  87.8  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 228 aa  87.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 231 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 229 aa  87.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.72 
 
 		 488 aa  87.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 231 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 223 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 887 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1074  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 433 aa  87  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 246 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 246 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  35.25 
 
 		 229 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 387 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 246 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40 
 
 		 704 aa  86.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 230 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 309 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 386 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  40.18 
 
 		 309 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 230 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 		 231 aa  86.3  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 239 aa  86.3  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 308 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 278 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 230 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 230 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 		 395 aa  86.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.37 
 
 		 308 aa  85.5  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0573  two component transcriptional regulator  40.31 
 
 		 243 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437899  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 437 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  37.39 
 
 		 121 aa  85.9  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 317 aa  85.9  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 397 aa  85.5  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0515  two component transcriptional regulator  40.94 
 
 		 244 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000767404  normal  0.580599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 246 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 246 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 576 aa  85.5  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 245 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 301 aa  85.1  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 1468 aa  85.1  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0748  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 312 aa  85.1  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>