255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0538 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 392 aa  796    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  58.71 
 
 		 391 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  53.83 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  53.11 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  58.17 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  58.17 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  49.2 
 
 		 394 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  47.06 
 
 		 395 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  47.33 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  42.9 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  39.74 
 
 		 374 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  40.21 
 
 		 389 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  39.42 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  38.56 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  38.99 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  39.19 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  35.36 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  38.4 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  34.38 
 
 		 401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  34.83 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  34.32 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  35.45 
 
 		 386 aa  223  6e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  30.6 
 
 		 356 aa  203  5e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  29.1 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  27.59 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.72 
 
 		 389 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  27.84 
 
 		 1040 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  26.4 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.19 
 
 		 418 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 		 423 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  27.13 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.23 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.71 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.32 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.34 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 		 360 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  27.44 
 
 		 361 aa  106  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  23.2 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  24.76 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.72 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  22.7 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  23.04 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.86 
 
 		 1061 aa  99.4  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  26.88 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.49 
 
 		 792 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  24.04 
 
 		 1096 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  25.59 
 
 		 1061 aa  98.2  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  22.25 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.06 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  26.45 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 360 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 360 aa  90.5  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.4 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  20.54 
 
 		 360 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 1111 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 1153 aa  83.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.16 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  21.45 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  21.18 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  23.97 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  21.61 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.4 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  22.97 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  25.73 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.7 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  21.78 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  20.53 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  22.78 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  18.52 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  19.28 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  25.16 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  21.61 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0837  hypothetical protein  21.27 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00840057  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  22.51 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  20.63 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  28.46 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  21.35 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  22.41 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>