67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1326 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1130    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  51.4 
 
 		 542 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  51.32 
 
 		 547 aa  485  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  45.56 
 
 		 673 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  43.49 
 
 		 802 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  41.31 
 
 		 525 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  41.31 
 
 		 525 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  40.93 
 
 		 525 aa  327  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  39.51 
 
 		 590 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  38.72 
 
 		 555 aa  278  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  38.44 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  37.56 
 
 		 585 aa  274  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.24 
 
 		 550 aa  272  9e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  37.18 
 
 		 564 aa  264  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  40.6 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  46.76 
 
 		 532 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  42.89 
 
 		 542 aa  256  9e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  41.5 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  39.87 
 
 		 539 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  32.67 
 
 		 589 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  46.35 
 
 		 517 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  37.01 
 
 		 586 aa  219  8.999999999999998e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  44.06 
 
 		 524 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  37.03 
 
 		 568 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  48.43 
 
 		 453 aa  200  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  39.61 
 
 		 518 aa  199  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  40.19 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  41.56 
 
 		 523 aa  186  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  31.86 
 
 		 578 aa  186  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  31.11 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  32.92 
 
 		 569 aa  73.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  29.91 
 
 		 564 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  30.66 
 
 		 619 aa  70.9  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  30.54 
 
 		 571 aa  70.5  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  27.92 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  31.82 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  31.11 
 
 		 667 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  30.1 
 
 		 687 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  28.45 
 
 		 571 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  31.53 
 
 		 669 aa  60.1  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  30.69 
 
 		 631 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  30.93 
 
 		 584 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  27.2 
 
 		 566 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  27.75 
 
 		 551 aa  55.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  28.87 
 
 		 650 aa  54.7  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  30.35 
 
 		 565 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  27.16 
 
 		 540 aa  52.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 526 aa  52.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  28.95 
 
 		 576 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  27.07 
 
 		 1164 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  28.95 
 
 		 586 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  28.95 
 
 		 586 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  30.65 
 
 		 556 aa  50.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  27.5 
 
 		 572 aa  50.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  26.14 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  25.98 
 
 		 564 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  31.31 
 
 		 784 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  20.46 
 
 		 523 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  29.23 
 
 		 629 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  24.28 
 
 		 546 aa  47  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  27.04 
 
 		 551 aa  47  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.18 
 
 		 599 aa  47  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  27.37 
 
 		 642 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25 
 
 		 1249 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  21.94 
 
 		 674 aa  45.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  27.73 
 
 		 636 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  30.73 
 
 		 571 aa  43.5  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>