More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2022 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  60.14 
 
 
143 aa  179  8.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  57.48 
 
 
147 aa  143  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  50.76 
 
 
136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 
145 aa  117  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  41.61 
 
 
147 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  41.1 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
146 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
146 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
147 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 
145 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  40.43 
 
 
143 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 
145 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
147 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
148 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 
145 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  40.27 
 
 
149 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 
147 aa  100  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  41.78 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40.85 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
144 aa  94.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  36.76 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  41.26 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  37.5 
 
 
162 aa  94  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  39.47 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  33.57 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
142 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  36.88 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  36.3 
 
 
144 aa  92  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  39.86 
 
 
145 aa  91.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
145 aa  91.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
155 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  41.43 
 
 
139 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
158 aa  90.5  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
153 aa  90.1  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  40.65 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
176 aa  89.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
230 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  35.34 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
189 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
144 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  40.41 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0514  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
184 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.33 
 
 
260 aa  87.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
152 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  43.43 
 
 
134 aa  87  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 
189 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.25 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.25 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  36.36 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
176 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
146 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
151 aa  84  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  38.21 
 
 
152 aa  83.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  39.64 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  44.34 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  35.96 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>