More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1182 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2642  extracellular solute-binding protein family 5  47.38 
 
 		 775 aa  667    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1264  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  50.92 
 
 		 721 aa  717    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00386395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1021  hypothetical protein  49.06 
 
 		 718 aa  676    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0988  hypothetical protein  49.06 
 
 		 718 aa  676    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1224  extracellular solute-binding protein  50.07 
 
 		 734 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0461762  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1671  oligopeptide ABC transporter periplasmic component  51.37 
 
 		 713 aa  740    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.142506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1768  extracellular solute-binding protein  54.29 
 
 		 749 aa  759    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0093  oligopeptide-binding protein  48.1 
 
 		 744 aa  671    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.386924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1182  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 709 aa  1459    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.256161  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2334  extracellular solute-binding protein  50.62 
 
 		 755 aa  753    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2033  extracellular solute-binding protein  39.36 
 
 		 741 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.240451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1750  putative extracellular solute-binding protein  39.28 
 
 		 758 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1498  hypothetical protein  27.46 
 
 		 586 aa  211  5e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1502  hypothetical protein  27.46 
 
 		 586 aa  211  5e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3695  putative binding protein component of ABC transporter  24.77 
 
 		 600 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 544 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 594 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.9 
 
 		 532 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.32 
 
 		 544 aa  108  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 622 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.4 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.28 
 
 		 545 aa  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 545 aa  101  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 		 546 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4296  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 531 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 		 531 aa  99  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 532 aa  98.6  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  22.82 
 
 		 540 aa  97.8  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 532 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.78 
 
 		 565 aa  94.7  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  22.63 
 
 		 588 aa  94.4  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 531 aa  93.6  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.83 
 
 		 535 aa  93.2  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 540 aa  91.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 531 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  21.37 
 
 		 540 aa  90.5  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 		 543 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 544 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 508 aa  89.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.12 
 
 		 544 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 		 534 aa  89  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  21.39 
 
 		 530 aa  88.6  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 536 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  22.37 
 
 		 528 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 		 528 aa  87.8  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  21.48 
 
 		 536 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  20.19 
 
 		 544 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.15 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 552 aa  86.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  21.74 
 
 		 589 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.9 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 531 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 534 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 531 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 534 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.21 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.94 
 
 		 586 aa  82.4  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.01 
 
 		 528 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  24.93 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 545 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.83 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 523 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.83 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  22.43 
 
 		 531 aa  80.9  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.83 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.83 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.83 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.83 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 528 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 		 506 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  22.11 
 
 		 566 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  21.34 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.593779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  25.81 
 
 		 533 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 531 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  21.79 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  22.36 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.05 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  22.25 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  22.76 
 
 		 535 aa  78.2  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.4 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.4 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.4 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.4 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.4 
 
 		 526 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  29.31 
 
 		 530 aa  77  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>