More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1768 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1264  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  58.33 
 
 		 721 aa  825    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00386395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1021  hypothetical protein  55.01 
 
 		 718 aa  799    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0988  hypothetical protein  55.15 
 
 		 718 aa  799    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1224  extracellular solute-binding protein  56.92 
 
 		 734 aa  838    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0461762  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1671  oligopeptide ABC transporter periplasmic component  62.64 
 
 		 713 aa  904    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.142506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1768  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 749 aa  1537    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0093  oligopeptide-binding protein  54.88 
 
 		 744 aa  807    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.386924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1182  extracellular solute-binding protein  53.11 
 
 		 709 aa  760    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.256161  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2334  extracellular solute-binding protein  62.38 
 
 		 755 aa  957    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2642  extracellular solute-binding protein family 5  55.52 
 
 		 775 aa  780    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2033  extracellular solute-binding protein  44.94 
 
 		 741 aa  616  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.240451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1750  putative extracellular solute-binding protein  46.41 
 
 		 758 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1502  hypothetical protein  27.63 
 
 		 586 aa  229  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1498  hypothetical protein  27.63 
 
 		 586 aa  229  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3695  putative binding protein component of ABC transporter  27.29 
 
 		 600 aa  194  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 544 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 544 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  23.73 
 
 		 532 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 		 565 aa  111  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.43 
 
 		 534 aa  108  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  23.62 
 
 		 535 aa  108  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 506 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 543 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.6 
 
 		 545 aa  104  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 		 622 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  23.55 
 
 		 540 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 		 594 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 532 aa  101  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 545 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  23.36 
 
 		 540 aa  98.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 588 aa  98.6  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 540 aa  98.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 535 aa  98.2  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  23.76 
 
 		 520 aa  97.8  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.71 
 
 		 586 aa  97.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.79 
 
 		 505 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  23.96 
 
 		 544 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  22.95 
 
 		 524 aa  92  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  21.29 
 
 		 546 aa  92  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 		 589 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 541 aa  91.3  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  22.69 
 
 		 526 aa  91.3  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 545 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 544 aa  90.9  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 		 552 aa  90.1  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.18 
 
 		 586 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 531 aa  89  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 542 aa  89  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  23.21 
 
 		 530 aa  88.6  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 531 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  21.95 
 
 		 535 aa  88.2  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 		 547 aa  87.8  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 538 aa  87.4  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 508 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 545 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  21.71 
 
 		 535 aa  84  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  21.12 
 
 		 537 aa  83.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 538 aa  83.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  23.74 
 
 		 528 aa  83.2  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 533 aa  83.2  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 553 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.51 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.76 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  22 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.593779  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  19.77 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.76 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.76 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.76 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  21.47 
 
 		 538 aa  81.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.63 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  21.18 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  21.99 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 528 aa  80.5  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 525 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  23.23 
 
 		 516 aa  80.5  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 525 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  21.51 
 
 		 534 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  18.9 
 
 		 532 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 528 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.53 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  22.89 
 
 		 532 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.76 
 
 		 532 aa  79.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4296  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 531 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  21.23 
 
 		 533 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0479  peptide transport periplasmic protein precursor SapA  24.52 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  20.62 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  22.82 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  20.34 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  23.02 
 
 		 530 aa  79  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>