More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2642 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1264  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  54.07 
 
 
721 aa  746    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00386395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2642  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
775 aa  1577    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1021  hypothetical protein  48.08 
 
 
718 aa  713    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0988  hypothetical protein  48.15 
 
 
718 aa  712    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1224  extracellular solute-binding protein  60.27 
 
 
734 aa  919    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0461762  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1671  oligopeptide ABC transporter periplasmic component  56.98 
 
 
713 aa  819    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.142506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1768  extracellular solute-binding protein  54.5 
 
 
749 aa  792    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1182  extracellular solute-binding protein  46.38 
 
 
709 aa  678    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.256161  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2334  extracellular solute-binding protein  58.15 
 
 
755 aa  872    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0093  oligopeptide-binding protein  49.18 
 
 
744 aa  736    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.386924  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2033  extracellular solute-binding protein  46.68 
 
 
741 aa  635  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.240451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1750  putative extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 
758 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1498  hypothetical protein  31.28 
 
 
586 aa  250  8e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1502  hypothetical protein  31.28 
 
 
586 aa  250  8e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3695  putative binding protein component of ABC transporter  28.61 
 
 
600 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 
544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
594 aa  127  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
544 aa  124  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.74 
 
 
565 aa  110  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.47 
 
 
520 aa  103  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  24.47 
 
 
622 aa  101  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
535 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 
545 aa  96.3  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
532 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  22 
 
 
532 aa  94.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  22.67 
 
 
531 aa  94.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 
544 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 
544 aa  93.6  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.97 
 
 
586 aa  92.8  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
558 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
531 aa  92.4  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  24.32 
 
 
588 aa  92  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 
576 aa  92  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 
530 aa  91.3  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
533 aa  90.9  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
508 aa  90.9  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.83 
 
 
543 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.83 
 
 
543 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.83 
 
 
543 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  21.1 
 
 
534 aa  90.1  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  23.95 
 
 
589 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  25.33 
 
 
554 aa  89.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  23.63 
 
 
540 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
529 aa  89  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  21.06 
 
 
545 aa  88.2  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  23.35 
 
 
540 aa  87.8  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.64 
 
 
543 aa  87.4  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 
532 aa  87.4  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  21.63 
 
 
537 aa  87  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  22.97 
 
 
526 aa  87  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  21.77 
 
 
535 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
532 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  20.15 
 
 
531 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  25.06 
 
 
529 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 
540 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
529 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  21.69 
 
 
535 aa  85.5  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.97 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 
565 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 
532 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  21.13 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
545 aa  84.3  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0479  peptide transport periplasmic protein precursor SapA  21.49 
 
 
541 aa  84  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  22.51 
 
 
506 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  23.38 
 
 
532 aa  83.2  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.65 
 
 
550 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 
528 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414652 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  22.57 
 
 
558 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  22.77 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 
563 aa  82  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 
532 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 
528 aa  82  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  22.35 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.35 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  22.1 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.35 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  22.35 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  21.85 
 
 
530 aa  80.9  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  21.66 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.56 
 
 
545 aa  80.9  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.61 
 
 
546 aa  80.9  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12520  dipeptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding component  22.45 
 
 
537 aa  80.1  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0296833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.57 
 
 
558 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
523 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  23.17 
 
 
556 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.04 
 
 
543 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  23.08 
 
 
544 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.04 
 
 
528 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  21.58 
 
 
535 aa  80.1  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
535 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0332  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
523 aa  80.1  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  22.92 
 
 
537 aa  79  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
552 aa  79  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.25 
 
 
537 aa  78.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 
537 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 
547 aa  78.6  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
536 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
543 aa  78.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 
547 aa  78.2  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>