More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1224 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1264  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  57.06 
 
 		 721 aa  816    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00386395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1021  hypothetical protein  51 
 
 		 718 aa  733    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0988  hypothetical protein  51.14 
 
 		 718 aa  734    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1224  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 734 aa  1513    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0461762  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1671  oligopeptide ABC transporter periplasmic component  61.17 
 
 		 713 aa  879    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.142506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2642  extracellular solute-binding protein family 5  61.24 
 
 		 775 aa  890    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295666  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1768  extracellular solute-binding protein  56.92 
 
 		 749 aa  835    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1182  extracellular solute-binding protein  50.07 
 
 		 709 aa  725    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.256161  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2334  extracellular solute-binding protein  58.43 
 
 		 755 aa  890    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0093  oligopeptide-binding protein  49.38 
 
 		 744 aa  736    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.386924  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2033  extracellular solute-binding protein  45.75 
 
 		 741 aa  622  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.240451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1750  putative extracellular solute-binding protein  44.33 
 
 		 758 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1498  hypothetical protein  30.82 
 
 		 586 aa  251  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1502  hypothetical protein  30.82 
 
 		 586 aa  251  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3695  putative binding protein component of ABC transporter  27.8 
 
 		 600 aa  196  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 544 aa  151  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 		 544 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 		 594 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 531 aa  123  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.8 
 
 		 532 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.51 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  24.88 
 
 		 540 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  24.56 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 622 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  23.96 
 
 		 530 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 545 aa  111  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 535 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 531 aa  108  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 534 aa  108  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.09 
 
 		 531 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 531 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  23.38 
 
 		 531 aa  104  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 530 aa  104  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  22.34 
 
 		 546 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 		 535 aa  103  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 544 aa  103  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.75 
 
 		 520 aa  102  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 531 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  23.29 
 
 		 544 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 		 535 aa  100  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 535 aa  100  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  30.65 
 
 		 530 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  24.36 
 
 		 533 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  24.65 
 
 		 524 aa  97.8  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 		 589 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  24.16 
 
 		 531 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.47 
 
 		 526 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 531 aa  97.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.47 
 
 		 526 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.47 
 
 		 526 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.47 
 
 		 526 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  24.47 
 
 		 535 aa  96.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  24.47 
 
 		 535 aa  96.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.47 
 
 		 535 aa  96.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.47 
 
 		 526 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 506 aa  95.5  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.46 
 
 		 565 aa  94.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.22 
 
 		 545 aa  94  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 		 528 aa  94  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 532 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 535 aa  92.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 		 535 aa  92  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 532 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.35 
 
 		 558 aa  91.7  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 538 aa  91.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 588 aa  90.9  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.22 
 
 		 544 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 		 543 aa  90.9  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 531 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  22.54 
 
 		 532 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  22.24 
 
 		 531 aa  90.9  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  23.02 
 
 		 506 aa  90.5  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 531 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  23.34 
 
 		 530 aa  90.1  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 541 aa  90.1  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  22.8 
 
 		 535 aa  90.5  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 536 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 		 532 aa  89.7  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 536 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 542 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 542 aa  89  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 541 aa  89  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  23.31 
 
 		 563 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  25.52 
 
 		 532 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.26 
 
 		 535 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 538 aa  88.6  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 		 531 aa  88.6  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  23.26 
 
 		 535 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.26 
 
 		 535 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.26 
 
 		 535 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  23.26 
 
 		 535 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  21.63 
 
 		 541 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  23.26 
 
 		 535 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 531 aa  88.2  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.76 
 
 		 586 aa  88.2  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.96 
 
 		 546 aa  88.2  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>