More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1021 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1264  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  52.75 
 
 
721 aa  741    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00386395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0093  oligopeptide-binding protein  56.38 
 
 
744 aa  815    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.386924  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1021  hypothetical protein  100 
 
 
718 aa  1475    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0988  hypothetical protein  98.75 
 
 
718 aa  1459    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1224  extracellular solute-binding protein  51 
 
 
734 aa  724    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0461762  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1671  oligopeptide ABC transporter periplasmic component  53.37 
 
 
713 aa  770    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.142506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1768  extracellular solute-binding protein  55.01 
 
 
749 aa  785    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1182  extracellular solute-binding protein  49.06 
 
 
709 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.256161  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2334  extracellular solute-binding protein  53.23 
 
 
755 aa  795    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2642  extracellular solute-binding protein family 5  48.69 
 
 
775 aa  686    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2033  extracellular solute-binding protein  41.38 
 
 
741 aa  537  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.240451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1750  putative extracellular solute-binding protein  40.46 
 
 
758 aa  525  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1502  hypothetical protein  27.85 
 
 
586 aa  227  7e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1498  hypothetical protein  27.85 
 
 
586 aa  227  7e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3695  putative binding protein component of ABC transporter  25.86 
 
 
600 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 
544 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
594 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 
544 aa  138  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.81 
 
 
535 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.59 
 
 
532 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
544 aa  114  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  23.71 
 
 
543 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 
545 aa  109  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.24 
 
 
520 aa  108  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.43 
 
 
545 aa  107  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 
622 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
532 aa  105  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.46 
 
 
565 aa  104  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  25 
 
 
540 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 
531 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  24.76 
 
 
540 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
530 aa  101  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  23.52 
 
 
546 aa  101  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 
545 aa  101  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
540 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
542 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 
532 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 
544 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  23.83 
 
 
537 aa  97.4  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
531 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  23.58 
 
 
531 aa  96.3  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.34 
 
 
544 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 
536 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.12 
 
 
543 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.12 
 
 
543 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  22.31 
 
 
589 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.12 
 
 
543 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  22.09 
 
 
531 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
538 aa  94.4  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.3 
 
 
543 aa  94  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.12 
 
 
543 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  25.12 
 
 
516 aa  92.8  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
547 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  23.02 
 
 
544 aa  92  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  24.1 
 
 
524 aa  91.7  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 
539 aa  91.3  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
538 aa  90.9  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2491  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 
592 aa  89.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640933  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  22.96 
 
 
528 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5167  4-phytase  23.41 
 
 
530 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  0.719428 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.29 
 
 
586 aa  89.7  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  23.93 
 
 
554 aa  89.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 
508 aa  89  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 
542 aa  89  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 
536 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 
523 aa  88.6  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4296  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 
531 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257984  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  23.79 
 
 
506 aa  88.2  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 
531 aa  88.2  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  22.82 
 
 
535 aa  87.8  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  21.86 
 
 
538 aa  87.8  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.593779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  21.86 
 
 
528 aa  87.4  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  23.3 
 
 
532 aa  87.4  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 
532 aa  87.4  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.17 
 
 
528 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3852  extracellular solute-binding protein family 5  23.04 
 
 
536 aa  86.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000990708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.55 
 
 
586 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
538 aa  85.5  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.37 
 
 
528 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 
534 aa  85.1  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
543 aa  85.1  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.37 
 
 
528 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.37 
 
 
528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.37 
 
 
528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.37 
 
 
528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.37 
 
 
528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.37 
 
 
528 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 
550 aa  84  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  21.26 
 
 
553 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
533 aa  83.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  21.28 
 
 
532 aa  83.2  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  22.39 
 
 
531 aa  83.2  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.37 
 
 
543 aa  83.2  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
535 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  21.77 
 
 
531 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 
529 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  24.04 
 
 
530 aa  82.4  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 
517 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>