131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2967 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 82 aa  173  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  69.74 
 
 		 78 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  68.92 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  64.86 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  60.81 
 
 		 80 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  59.46 
 
 		 80 aa  98.6  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  53.09 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  62.16 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  60.81 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  60.81 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  60.81 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  58.11 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  59.21 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  54.67 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  63.51 
 
 		 81 aa  93.6  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  58.11 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  58.67 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  55.41 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  58.67 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  52.63 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  54.67 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  57.89 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  51.25 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  49.33 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  52.78 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  49.35 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  50.67 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  47.3 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  50.65 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  48.68 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  48.65 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  57.14 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  47.3 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  48.48 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  40.91 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  40.79 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  37.5 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  36.49 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  33.78 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  33.78 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  34.25 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  33.72 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  40.68 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  34.72 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  33.8 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  31.94 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  37.14 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  34.72 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  35.19 
 
 		 116 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.72 
 
 		 85 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  31.94 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  37.29 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  31.08 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  37.93 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  53.66 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  30.16 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  28.17 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  33.33 
 
 		 229 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  39.62 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  39.34 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  32.31 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  31.94 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  45.65 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  36.36 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  37.7 
 
 		 384 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  35.62 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2973  glutaredoxin  35.42 
 
 		 66 aa  43.9  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.64594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  37.7 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  34.29 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  42.59 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  34.25 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  40.98 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  28.57 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  32.39 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  32.39 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  40.35 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  38.18 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  41.07 
 
 		 391 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  28.38 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  38.33 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  24.29 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  52.63 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  31.51 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  39.68 
 
 		 85 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.38 
 
 		 175 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  29.67 
 
 		 768 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>