More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0546 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
319 aa  625  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 
204 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  31.89 
 
 
203 aa  89.7  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  29.53 
 
 
201 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  35.33 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  31.72 
 
 
206 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  32.45 
 
 
214 aa  84  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  32.04 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  31.06 
 
 
172 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  30.36 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.49 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  28.9 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  29.7 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  29.83 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  31.98 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  30.86 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
196 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  31.98 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  35.29 
 
 
184 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  30.77 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  30.77 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  30.77 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  30.77 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  29.1 
 
 
221 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  31.18 
 
 
228 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  30.77 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  33.08 
 
 
196 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.94 
 
 
209 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  28.57 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  33.16 
 
 
229 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  30.11 
 
 
229 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  30 
 
 
197 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  27.37 
 
 
216 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 
225 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 
221 aa  62.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  31.74 
 
 
207 aa  62.4  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  29.56 
 
 
202 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  27.94 
 
 
218 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  27.94 
 
 
218 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
197 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 
227 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  27.94 
 
 
218 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  27.62 
 
 
224 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  28.49 
 
 
218 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  35.77 
 
 
196 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  35.77 
 
 
196 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  29.29 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 
218 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  29.21 
 
 
218 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
228 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  33.88 
 
 
225 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  30.39 
 
 
216 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.39 
 
 
216 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  25.79 
 
 
225 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  30.39 
 
 
216 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  30.39 
 
 
216 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  30.39 
 
 
216 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 
221 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  31.71 
 
 
218 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  28.93 
 
 
206 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  31.41 
 
 
223 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  29.32 
 
 
202 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  30.39 
 
 
216 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  30.39 
 
 
216 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.21 
 
 
236 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  30.39 
 
 
216 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
226 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  32.98 
 
 
209 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 
237 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.93 
 
 
211 aa  59.3  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  29.83 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  31.44 
 
 
232 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  29.83 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  28.93 
 
 
203 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  28.93 
 
 
210 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  29.83 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  29.81 
 
 
216 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  28.49 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 
223 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.95 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
228 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
241 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  29.34 
 
 
205 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3208  hydrolase  26.91 
 
 
227 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  30.91 
 
 
224 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  29.37 
 
 
216 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.27 
 
 
199 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.45 
 
 
735 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
238 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
214 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 
223 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 
221 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  29.83 
 
 
197 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  27.56 
 
 
224 aa  56.2  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
214 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  25.39 
 
 
238 aa  55.8  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>