More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1466 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1420  peptide chain release factor 1  98.54 
 
 		 342 aa  680    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1466  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 342 aa  685    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1395  peptide chain release factor 1  58.61 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0279  peptide chain release factor 1  55.85 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.156801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  55.94 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  68.78 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  55.33 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  54.94 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  59.22 
 
 		 356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  54.1 
 
 		 357 aa  354  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  53.92 
 
 		 357 aa  351  8e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.75 
 
 		 356 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 359 aa  345  6e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  53.24 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  51.18 
 
 		 355 aa  338  9e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  58.48 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  53.87 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  53.87 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 		 358 aa  335  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  52.13 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  58.71 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  50.74 
 
 		 359 aa  329  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 359 aa  329  4e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  50.74 
 
 		 377 aa  328  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  62.7 
 
 		 355 aa  328  7e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 360 aa  328  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  50.74 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  51.63 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 354 aa  327  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  57.04 
 
 		 351 aa  325  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  51.04 
 
 		 361 aa  325  9e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  61 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 		 355 aa  324  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  51.8 
 
 		 357 aa  323  2e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 357 aa  322  5e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  48.22 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  49.1 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  53.08 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  49.1 
 
 		 359 aa  318  7e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 362 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  59.57 
 
 		 357 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 355 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  54.89 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 359 aa  316  3e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 350 aa  316  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  46.87 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 		 356 aa  316  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  55.26 
 
 		 359 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  53.87 
 
 		 355 aa  315  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  47.77 
 
 		 362 aa  315  6e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 355 aa  315  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  46.29 
 
 		 361 aa  315  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  48.82 
 
 		 358 aa  315  8e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 358 aa  315  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  56.36 
 
 		 351 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  56.36 
 
 		 351 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  55.64 
 
 		 351 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  48.82 
 
 		 354 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  50.31 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  46.75 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  46.75 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  46.75 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  55.64 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  45.7 
 
 		 356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  46.75 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  46.75 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  46.75 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  46.75 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  48.26 
 
 		 364 aa  312  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  48.4 
 
 		 361 aa  312  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  46.45 
 
 		 358 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  48.4 
 
 		 361 aa  312  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  49.7 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  60.24 
 
 		 361 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 		 358 aa  311  6.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 		 358 aa  311  6.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  55.26 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  46.45 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  44.9 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  55.64 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  50.61 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  46.47 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  46.92 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  47.94 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  53.31 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  47.75 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  51.67 
 
 		 351 aa  309  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  48.99 
 
 		 358 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  48.5 
 
 		 360 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  55.6 
 
 		 334 aa  309  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  55.67 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>