More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1235 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  99.02 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  100 
 
 		 306 aa  620  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0652  signal peptidase I  53.49 
 
 		 295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1799  signal peptidase I  52.1 
 
 		 288 aa  285  5e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0193448  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0326  signal peptidase I  41.11 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  25.35 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  25.75 
 
 		 517 aa  94  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0292  signal peptidase I  25.56 
 
 		 432 aa  92.8  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  25.54 
 
 		 530 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  28.48 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  36.99 
 
 		 185 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  29.01 
 
 		 381 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  26.51 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  26.96 
 
 		 378 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  26.2 
 
 		 398 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  26.35 
 
 		 268 aa  86.3  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  42.19 
 
 		 185 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  27.51 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  25.18 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  28.01 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  36.22 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  27.81 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  26.71 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  25.98 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  26.86 
 
 		 517 aa  83.2  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  25.07 
 
 		 389 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  24.12 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  26.44 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  36.43 
 
 		 214 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  38.74 
 
 		 190 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  39.37 
 
 		 176 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  36.13 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  25.62 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  27.58 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  24.32 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  25.98 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  25.82 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  32.59 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  25.82 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  26.28 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  32.21 
 
 		 198 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  24.32 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  25.82 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  25.33 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  33.81 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  31.71 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  32.31 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  25.41 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  25.17 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  33.8 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  26.73 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  23.1 
 
 		 465 aa  75.9  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  25.25 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  32.77 
 
 		 192 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  34.15 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  31.36 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  25.16 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  32.77 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.53 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  36 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  37.3 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  32.43 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  24.66 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  24.82 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  25.35 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  35.04 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  31.88 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  36.51 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  31.71 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  32.5 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  32.5 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  37.82 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  23.55 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  24.83 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  26.76 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  25.34 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  34.27 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  25.68 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  39.32 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  34.13 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  35.62 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0031  signal peptidase I  23.4 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  28.48 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  30.95 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4299  signal peptidase I  33.06 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  34.92 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  33.13 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  39.68 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  33.13 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  34.43 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  25.94 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  32.87 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  29.13 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  29.8 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  34.92 
 
 		 187 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  30.1 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  29.52 
 
 		 247 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  36.89 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  34.92 
 
 		 187 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  31.1 
 
 		 221 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>