85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0961 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  100 
 
 		 161 aa  315  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  95.65 
 
 		 161 aa  285  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  55.2 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  40.15 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  41.73 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  32.39 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.67 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  34.78 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  37.58 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.99 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  31.17 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  27.54 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  29.03 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  28.97 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  29.58 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  32.56 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  26.47 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  27.03 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  37.63 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  29.53 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  30 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  29.14 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  24.84 
 
 		 227 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  26.9 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  29.25 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  28.48 
 
 		 269 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  34.51 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  27.4 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  25.87 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  33.93 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  27.14 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  31.87 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  27.04 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  31.16 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  30.87 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  26.85 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  24.18 
 
 		 267 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  26.57 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  29.03 
 
 		 212 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  30.68 
 
 		 271 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  27.39 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  32.18 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  26.35 
 
 		 264 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  26.8 
 
 		 217 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  30.43 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  23.81 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  27.63 
 
 		 228 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  26.24 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 272 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  28.86 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 272 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  34.69 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  28.86 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  28.39 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  24.49 
 
 		 270 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  24.52 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  28.26 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  28.19 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  30.28 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  29.57 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3449  putative RecX protein  27.27 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  26.09 
 
 		 168 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  26.85 
 
 		 166 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  26.85 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  26.85 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  30.19 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  24.49 
 
 		 267 aa  41.6  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  28 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  24.46 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  31.09 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  26.53 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  26.53 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  26.14 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1693  hypothetical protein  53.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00217946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3513  putative RecX protein  26.62 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  23.33 
 
 		 270 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  29.66 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  23.81 
 
 		 270 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  23.57 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3367  putative RecX protein  36 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0141472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>