More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3035 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3035  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3593  ABC transporter related  74.8 
 
 		 255 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0468  ABC transporter, ATP-binding protein  73.73 
 
 		 255 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0407  ABC transporter, ATP-binding protein  73.73 
 
 		 255 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7503  ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 257 aa  287  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  42.75 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.53 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  43.94 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.45 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.53 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.02 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.92 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 260 aa  194  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  46.44 
 
 		 288 aa  194  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  41.84 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.63 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  47.09 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.2 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  49.51 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.19 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.19 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  38.8 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 265 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  42.31 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  43.21 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  41.18 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  47.34 
 
 		 306 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.15 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  44.4 
 
 		 287 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 		 272 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  41.13 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  42.4 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.93 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  39.53 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  42.08 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  48.86 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.83 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  43.1 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  48.29 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  39.74 
 
 		 272 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  45.5 
 
 		 315 aa  185  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  46.19 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  46.19 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  46.92 
 
 		 260 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  44.09 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.44 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.06 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.57 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  45.37 
 
 		 304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  40.16 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  45.74 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.34 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  38.82 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  50.25 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  39.37 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  41.7 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.84 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  44.59 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  42.02 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  42.86 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  37.79 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.33 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.9 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  46.89 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  39.26 
 
 		 267 aa  181  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  47.37 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  39.58 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  48.58 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  44.84 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  44.95 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  44.84 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  43.78 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14760  ABC transporter related  42.03 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  44.84 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  38.62 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  40.69 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  45.15 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  46.08 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10000  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.85 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0152878  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  40 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  38.28 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  42.54 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  46.92 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  42.03 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  45.74 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  38.89 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>