201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0947 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 731 aa  1489    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  44.67 
 
 		 714 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  44.67 
 
 		 714 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  41.1 
 
 		 715 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  43.39 
 
 		 716 aa  544  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  43.55 
 
 		 712 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  38.62 
 
 		 804 aa  492  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 		 743 aa  236  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  26.47 
 
 		 842 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  26.83 
 
 		 861 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  26.58 
 
 		 842 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  26.46 
 
 		 746 aa  206  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  27.26 
 
 		 767 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  25.68 
 
 		 833 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  24.97 
 
 		 831 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  25.51 
 
 		 837 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 829 aa  191  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  25.37 
 
 		 748 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  25.65 
 
 		 816 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  25.1 
 
 		 786 aa  188  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  24.81 
 
 		 786 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  25.1 
 
 		 833 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  26.21 
 
 		 859 aa  183  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  25.87 
 
 		 724 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  24.59 
 
 		 792 aa  181  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  26.7 
 
 		 886 aa  180  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  26.94 
 
 		 876 aa  178  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  26.94 
 
 		 876 aa  178  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  24.28 
 
 		 777 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  24.25 
 
 		 792 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  26.65 
 
 		 862 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  26.77 
 
 		 886 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  24.24 
 
 		 780 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  26.47 
 
 		 756 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  24.15 
 
 		 886 aa  167  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  24.24 
 
 		 776 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  24.16 
 
 		 784 aa  160  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  25.77 
 
 		 781 aa  157  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  21.56 
 
 		 791 aa  156  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  27.81 
 
 		 892 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 		 889 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  31.43 
 
 		 738 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  25.05 
 
 		 814 aa  107  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  26.87 
 
 		 799 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  24.62 
 
 		 773 aa  103  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  23.01 
 
 		 781 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  24.76 
 
 		 773 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  23.62 
 
 		 764 aa  101  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  24.26 
 
 		 774 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  24.82 
 
 		 774 aa  96.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  22.67 
 
 		 701 aa  97.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  22.67 
 
 		 727 aa  97.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  28.21 
 
 		 791 aa  95.9  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  28.09 
 
 		 826 aa  95.5  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  28.75 
 
 		 783 aa  95.1  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 		 822 aa  94.7  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  28.71 
 
 		 766 aa  94.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  23.29 
 
 		 762 aa  94.7  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  25.69 
 
 		 774 aa  94  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  26.44 
 
 		 813 aa  94  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  23.41 
 
 		 788 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  27.04 
 
 		 820 aa  92.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  21.13 
 
 		 781 aa  92.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  26.52 
 
 		 786 aa  90.9  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  26.4 
 
 		 784 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  26.4 
 
 		 784 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  26.09 
 
 		 786 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  26.4 
 
 		 784 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  26.4 
 
 		 784 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  26.4 
 
 		 784 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  26.4 
 
 		 784 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  25.76 
 
 		 784 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  26.09 
 
 		 786 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  27.81 
 
 		 785 aa  89  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  26.09 
 
 		 786 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  27.62 
 
 		 781 aa  89  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  23.53 
 
 		 765 aa  89  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  25.07 
 
 		 787 aa  89  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  26.09 
 
 		 786 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  26.4 
 
 		 784 aa  88.6  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  27.51 
 
 		 863 aa  87.4  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  27.19 
 
 		 765 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  23.72 
 
 		 765 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  23.72 
 
 		 765 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  23.31 
 
 		 765 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 792 aa  85.9  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  27.92 
 
 		 787 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  26.01 
 
 		 766 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  25.76 
 
 		 786 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 		 773 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  24.07 
 
 		 789 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  24.77 
 
 		 788 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  25.76 
 
 		 786 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  25.76 
 
 		 786 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  26.99 
 
 		 819 aa  85.1  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  27.75 
 
 		 786 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 		 792 aa  84.7  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  30.4 
 
 		 771 aa  84.7  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  27.75 
 
 		 786 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  23.67 
 
 		 753 aa  84.7  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>