285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0907 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  72.97 
 
 		 229 aa  322  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  78.37 
 
 		 211 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  76.92 
 
 		 211 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  76.92 
 
 		 211 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  69.91 
 
 		 228 aa  300  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  69.31 
 
 		 221 aa  280  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  58.08 
 
 		 242 aa  208  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  57.07 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  57.07 
 
 		 241 aa  203  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  54.4 
 
 		 385 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  56.35 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  53.44 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  56.97 
 
 		 432 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  57.58 
 
 		 389 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  57.58 
 
 		 358 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  53.85 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  54.36 
 
 		 242 aa  188  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  54.4 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  52.82 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  56.97 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  48.82 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  51.89 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  52 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.46 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  57.8 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.06 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.49 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  55.49 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  47.69 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  54.39 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  54.74 
 
 		 195 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  49.1 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  48.81 
 
 		 185 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  50.75 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.09 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.41 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  41.67 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  41.04 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  41.67 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.5 
 
 		 534 aa  118  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  40.48 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  39.78 
 
 		 399 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  37.28 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  36.06 
 
 		 337 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  40.7 
 
 		 264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  41.14 
 
 		 201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  38.18 
 
 		 349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  33.53 
 
 		 352 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.1 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 442 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 442 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  38.79 
 
 		 343 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 345 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 442 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 442 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 250 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 456 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 458 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 340 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  38.82 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 345 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 455 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 345 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 456 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 340 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  36.55 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  36.9 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  39.2 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  39.2 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 360 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  36.9 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.65 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  38.82 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  37.93 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  45.52 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4816  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  36.97 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  41.04 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.88 
 
 		 389 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  38.18 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  38.41 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  38.18 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  38.18 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  38.18 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  34.2 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.41 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  38.41 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  37.5 
 
 		 408 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  39.51 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 254 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  36.16 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  37.85 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>