87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0872 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  46.73 
 
 		 793 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  52.15 
 
 		 743 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  53.57 
 
 		 781 aa  754    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  60.41 
 
 		 783 aa  954    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  56.99 
 
 		 772 aa  865    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  60.41 
 
 		 783 aa  954    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  56.99 
 
 		 772 aa  865    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  72.57 
 
 		 773 aa  1118    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  54.71 
 
 		 785 aa  856    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  52.91 
 
 		 802 aa  801    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  46.86 
 
 		 773 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  54.03 
 
 		 781 aa  794    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  43.25 
 
 		 777 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  53.73 
 
 		 788 aa  750    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  52.44 
 
 		 778 aa  758    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 773 aa  1570    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  55.73 
 
 		 785 aa  870    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  53.74 
 
 		 786 aa  827    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  34.93 
 
 		 756 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  35.46 
 
 		 773 aa  419  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  36.12 
 
 		 759 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  36.12 
 
 		 759 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  33.29 
 
 		 757 aa  415  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  35.75 
 
 		 749 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  34.89 
 
 		 766 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  36.69 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  31.68 
 
 		 769 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  34.67 
 
 		 605 aa  230  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  33.27 
 
 		 517 aa  225  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  39.45 
 
 		 805 aa  207  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  39.45 
 
 		 831 aa  207  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  38.41 
 
 		 852 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  33.4 
 
 		 578 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  37.07 
 
 		 842 aa  195  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  34.92 
 
 		 913 aa  187  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.58 
 
 		 562 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  36.67 
 
 		 637 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  35.15 
 
 		 705 aa  180  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  29.07 
 
 		 1006 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  33.43 
 
 		 614 aa  170  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  35.83 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 		 607 aa  169  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  34.62 
 
 		 689 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  33.52 
 
 		 612 aa  165  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  34.62 
 
 		 689 aa  164  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  32.38 
 
 		 677 aa  162  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  33.47 
 
 		 532 aa  160  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  34.68 
 
 		 644 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  33.22 
 
 		 633 aa  158  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.23 
 
 		 618 aa  158  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  32.44 
 
 		 519 aa  157  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  34.11 
 
 		 631 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  33.76 
 
 		 647 aa  150  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  34.43 
 
 		 624 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  34.43 
 
 		 624 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  33.22 
 
 		 633 aa  147  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  36.3 
 
 		 576 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  32.87 
 
 		 633 aa  145  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  32.53 
 
 		 636 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  35.15 
 
 		 618 aa  143  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 638 aa  143  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  33.66 
 
 		 650 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  34.43 
 
 		 645 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  33.91 
 
 		 612 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  33.56 
 
 		 612 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  32.55 
 
 		 564 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  30.45 
 
 		 647 aa  133  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  31.38 
 
 		 570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  31.38 
 
 		 570 aa  129  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  31.38 
 
 		 570 aa  129  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  33.06 
 
 		 637 aa  127  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  32.96 
 
 		 570 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  29.68 
 
 		 674 aa  125  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  34.78 
 
 		 571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  34.4 
 
 		 571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  34.4 
 
 		 571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  29.6 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  29.07 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  29.07 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  26.26 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  31.22 
 
 		 510 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  30.6 
 
 		 552 aa  73.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.12 
 
 		 678 aa  51.2  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  26.57 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  23.41 
 
 		 582 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  30.77 
 
 		 601 aa  45.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  23.67 
 
 		 584 aa  44.3  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>