74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0248 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0248  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1248    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.606779  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1994  C-terminal processing peptidase-1  33.33 
 
 		 703 aa  57.4  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.754178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 		 428 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1366  carboxyl-terminal protease  32.63 
 
 		 687 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  29.23 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  35.29 
 
 		 433 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1022  peptidase S41A, C-terminal protease  32.63 
 
 		 707 aa  51.2  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000400969  normal  0.0227897 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  34.12 
 
 		 443 aa  50.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  31.3 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  32.14 
 
 		 401 aa  49.7  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  35.63 
 
 		 457 aa  49.7  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  31.3 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  31.03 
 
 		 423 aa  48.9  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  29.17 
 
 		 1076 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  34.12 
 
 		 417 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  30.63 
 
 		 463 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  33.73 
 
 		 429 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  29.6 
 
 		 441 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1252  carboxyl-terminal protease  31.58 
 
 		 697 aa  48.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  31.4 
 
 		 710 aa  47.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 		 426 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 721 aa  47.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  34.57 
 
 		 462 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  32.14 
 
 		 422 aa  47.4  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6521  carboxyl-terminal protease  27.55 
 
 		 709 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  29 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1217  carboxyl-terminal protease  30.53 
 
 		 674 aa  47  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  26.62 
 
 		 430 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1489  peptidase S41  34.82 
 
 		 317 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  32.95 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  26.28 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  32.95 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  27.04 
 
 		 438 aa  46.2  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  30.85 
 
 		 694 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2561  C-terminal processing peptidase  26.67 
 
 		 676 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0632  C-terminal processing peptidase-1  28.42 
 
 		 705 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  24.07 
 
 		 389 aa  45.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  30.77 
 
 		 433 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  34.57 
 
 		 468 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1519  C-terminal processing peptidase-1  32.67 
 
 		 698 aa  44.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  33.72 
 
 		 483 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  26.79 
 
 		 444 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  26.06 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1046  carboxyl-terminal protease  29.9 
 
 		 693 aa  45.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000142201  unclonable  0.00000192026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  25.17 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 		 556 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3394  peptidase S41  22.97 
 
 		 477 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0567862  normal  0.566348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  44.9 
 
 		 560 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 		 447 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  26.76 
 
 		 451 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  33.33 
 
 		 664 aa  44.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1326  carboxyl-terminal protease  28.42 
 
 		 674 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.91473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  26.79 
 
 		 444 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1152  carboxyl-terminal protease  31.96 
 
 		 683 aa  44.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 552 aa  44.3  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  27.56 
 
 		 428 aa  44.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  47.5 
 
 		 528 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 		 458 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  27.03 
 
 		 423 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  26.21 
 
 		 449 aa  44.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1354  peptidase S41  35.63 
 
 		 367 aa  44.3  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405316  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  32.1 
 
 		 432 aa  44.3  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  34.07 
 
 		 379 aa  44.3  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  30 
 
 		 401 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1363  carboxyl-terminal protease  29.47 
 
 		 688 aa  43.9  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  24.56 
 
 		 504 aa  43.9  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  31.4 
 
 		 480 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  30.53 
 
 		 444 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  28.46 
 
 		 437 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  38 
 
 		 544 aa  43.9  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0414  carboxyl-terminal protease  31.4 
 
 		 416 aa  43.9  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  28.57 
 
 		 341 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1802  carboxy-terminal protease  43.18 
 
 		 681 aa  43.5  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.308146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>