136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13759 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13759  oxidoreductase  100 
 
 
602 aa  1229    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649685  normal  0.108342 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  30.74 
 
 
565 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  26.6 
 
 
989 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
609 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  25.3 
 
 
594 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  25.3 
 
 
594 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  25.3 
 
 
594 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1394  hypothetical protein  23.43 
 
 
530 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  22.42 
 
 
500 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2295  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 
578 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 
570 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2309  hypothetical protein  26.37 
 
 
972 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2356  hypothetical protein  26.37 
 
 
972 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2348  hypothetical protein  26.37 
 
 
972 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 
577 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  22.89 
 
 
503 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.5 
 
 
433 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  34.48 
 
 
484 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  41.43 
 
 
589 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.48 
 
 
640 aa  53.5  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  37.35 
 
 
624 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  40.58 
 
 
479 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  20.77 
 
 
479 aa  51.6  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  24.4 
 
 
490 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  38.89 
 
 
472 aa  51.2  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  32.18 
 
 
484 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  24.4 
 
 
490 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  32.18 
 
 
499 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  32.18 
 
 
484 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  34.48 
 
 
479 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  38.89 
 
 
464 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  38.89 
 
 
462 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  36.11 
 
 
639 aa  50.8  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  40.58 
 
 
488 aa  50.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  50 
 
 
478 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  37.5 
 
 
472 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  46 
 
 
491 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  39.13 
 
 
483 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  36.84 
 
 
591 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  29.01 
 
 
410 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.62 
 
 
642 aa  50.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.57 
 
 
639 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  39.13 
 
 
486 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  37.5 
 
 
465 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  37.5 
 
 
466 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  37.5 
 
 
473 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  39.13 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  37.5 
 
 
466 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  36.11 
 
 
599 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  45 
 
 
428 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1045  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
433 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.687688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3433  putative dehydrogenase  40 
 
 
433 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  32.05 
 
 
552 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  39.13 
 
 
478 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  37.5 
 
 
474 aa  48.5  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  40.3 
 
 
394 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  32.56 
 
 
489 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  36.11 
 
 
471 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  55.1 
 
 
506 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.14 
 
 
643 aa  48.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  30.5 
 
 
949 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  33.33 
 
 
438 aa  47.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  36.11 
 
 
472 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  40.96 
 
 
434 aa  47.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  30.32 
 
 
482 aa  47.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  32.18 
 
 
645 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  40.23 
 
 
532 aa  47.4  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  38.24 
 
 
463 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  41.51 
 
 
533 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  30.93 
 
 
461 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  32.5 
 
 
455 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  39.13 
 
 
488 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  45.45 
 
 
501 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  57.14 
 
 
509 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  38.57 
 
 
644 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  35.62 
 
 
472 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  42.62 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
354 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  43.33 
 
 
330 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  47.62 
 
 
478 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  27.41 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  28.15 
 
 
478 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  47.62 
 
 
478 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3656  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.38 
 
 
405 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  41.51 
 
 
537 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  46.51 
 
 
501 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  28.15 
 
 
478 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  34.72 
 
 
475 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  42 
 
 
532 aa  45.8  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  39.13 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  34.72 
 
 
475 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  28.15 
 
 
478 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  28.15 
 
 
478 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  28.15 
 
 
478 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 
435 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 
540 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 
516 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  41.67 
 
 
425 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  35.96 
 
 
451 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  36.23 
 
 
453 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>