196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1399 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1399  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  764    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0373  hypothetical protein  26.36 
 
 		 416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3508  hypothetical protein  28.06 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2152  hypothetical protein  26.92 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1134  hypothetical protein  25.65 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1246  hypothetical protein  25.32 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1278  hypothetical protein  24.87 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4644  hypothetical protein  22.34 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.844377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3727  hypothetical protein  23.61 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  25.26 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  34.59 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  34.59 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  25.36 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  23.48 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  24.66 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  27.59 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  25.69 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  25.69 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  25.69 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.69 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  25.1 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  25.69 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.69 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0273562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.69 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  24.38 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  24.11 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  24.11 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  24.11 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.69 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2654  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.69 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4156  hypothetical protein  37.59 
 
 		 302 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  28.63 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1379  secretion protein HlyD family protein  23.55 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  24.03 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  24.03 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48350  hypothetical protein  36.92 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707172  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  28.51 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  23.54 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  23.28 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  22.75 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  25.33 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  26.03 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  26.03 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  32.23 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  26.03 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  26.03 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  26.03 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  26.03 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  26.03 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  24.66 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  22.22 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  25.5 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  22.69 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  23.53 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  25.41 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  32.31 
 
 		 304 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  34.21 
 
 		 333 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0850  secretion protein HlyD family protein  20.89 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.22 
 
 		 509 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  34.21 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1542  secretion protein HlyD family protein  31.03 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  31.86 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0460  multidrug resistance protein  28.65 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  24.4 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  22.34 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  27.94 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  24.36 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  33.64 
 
 		 300 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.55 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  24.27 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4314  MFS efflux pump, membrane fusion protein, EmrA subfamily  24.9 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  28.22 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  21.75 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.09 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1123  secretion protein HlyD family protein  23.17 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.911317  normal  0.519674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  21.73 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  25.1 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  21.73 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  22.81 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  21.73 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1389  hypothetical protein  25.77 
 
 		 519 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  30.28 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2312  hypothetical protein  25.77 
 
 		 516 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  30.28 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3235  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.28 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0503  hypothetical protein  25.77 
 
 		 478 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0145  hypothetical protein  25.77 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.955464  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1084  hypothetical protein  25.77 
 
 		 521 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0998  hypothetical protein  25.77 
 
 		 521 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  22.91 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  30.28 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.28 
 
 		 286 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0464  putative multidrug resistance protein  28.89 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387475  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 270 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6205  secretion protein HlyD  29.31 
 
 		 450 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  22.85 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1825  multidrug resistance protein  29.1 
 
 		 489 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.996701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  26.15 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>