More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1882 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1882  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0445  hypothetical protein  70.82 
 
 		 239 aa  324  6e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  47.52 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  46.05 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  46.08 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  42.26 
 
 		 1033 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  36.52 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  45.6 
 
 		 973 aa  79  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  43.87 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  35.12 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.55 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  37.19 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.18 
 
 		 576 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  33.78 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  34.16 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  39.74 
 
 		 745 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  34.34 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  36.31 
 
 		 862 aa  72.4  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  33.03 
 
 		 776 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  39.35 
 
 		 449 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  39.74 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  36.48 
 
 		 412 aa  72  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  37.66 
 
 		 291 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  37.34 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  33.84 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  35.59 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  37.42 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  37.11 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  35.81 
 
 		 567 aa  68.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  36.75 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  38.55 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  38 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  37.21 
 
 		 521 aa  68.2  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  38 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  35.21 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  38.67 
 
 		 1191 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  39.33 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  39.46 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  39.41 
 
 		 433 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  33.85 
 
 		 401 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  33.94 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  37.59 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  40.12 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  32.47 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 		 294 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  40.12 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  33.64 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  33.64 
 
 		 440 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  48.28 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  39.33 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 401 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  37.28 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  36.13 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.28 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  36.59 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  35.33 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.93 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  35.22 
 
 		 727 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  33.89 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  37.89 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  31.55 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  39.69 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  33.85 
 
 		 515 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  37.9 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  38.3 
 
 		 903 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27891  hypothetical protein  44.66 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.8 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  37.33 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  31.52 
 
 		 401 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  36.31 
 
 		 416 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.06 
 
 		 14916 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  31.52 
 
 		 401 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  36.88 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  32.32 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.54 
 
 		 343 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  32.35 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.54 
 
 		 343 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  34.09 
 
 		 408 aa  62.4  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  36.13 
 
 		 706 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  33.99 
 
 		 456 aa  62  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  36.42 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  35.67 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  37.82 
 
 		 824 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  36.11 
 
 		 176 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  30.88 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 		 146 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  39.1 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  38.19 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  36.11 
 
 		 176 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  38 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  30.86 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  37.98 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  33.72 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>