More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0202 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
381 aa  759    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  59.63 
 
 
377 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  55.04 
 
 
374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
904 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 
395 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
359 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
378 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
377 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  38.39 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
417 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  34.86 
 
 
406 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  33.94 
 
 
406 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  33.94 
 
 
406 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  39.18 
 
 
440 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
407 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  33.94 
 
 
406 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
422 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  33.94 
 
 
406 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
401 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
414 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
422 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
409 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  29.64 
 
 
419 aa  107  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
406 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  30.1 
 
 
391 aa  106  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
426 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  33.49 
 
 
406 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
415 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  33.49 
 
 
406 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
410 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  34.29 
 
 
406 aa  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
406 aa  103  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  34.29 
 
 
406 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
406 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.81 
 
 
406 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
398 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
416 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.81 
 
 
406 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
417 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
383 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
409 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
383 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  39.34 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
355 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 
417 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 
420 aa  96.3  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 
420 aa  96.3  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
413 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
366 aa  94  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  40.61 
 
 
374 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
401 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
368 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  38.32 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
406 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  41.35 
 
 
388 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  29.55 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
539 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  37.76 
 
 
410 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  32.64 
 
 
414 aa  90.1  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.36 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
378 aa  89.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
400 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.17 
 
 
400 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.2 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.15 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.92 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  34.2 
 
 
452 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  37.42 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
382 aa  87  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
411 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>