105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1206 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  100 
 
 		 174 aa  348  3e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  87.36 
 
 		 174 aa  309  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  54.97 
 
 		 169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  52.63 
 
 		 169 aa  189  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  54.39 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  54.39 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  54.97 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  50.29 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  54.39 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  54.97 
 
 		 169 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  45.18 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  45.78 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  48.59 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  44.85 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  43.37 
 
 		 161 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  42.26 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  44.58 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  44.58 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  41.67 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  43.37 
 
 		 161 aa  138  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  45.53 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  45.53 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  37.21 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  36.69 
 
 		 173 aa  121  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  40.44 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  38.03 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  36.05 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  36.69 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  34.12 
 
 		 173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  44.63 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  44.63 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  43.09 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  37.28 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  38.03 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  38.97 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  36.62 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  37.33 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  37.33 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  40.77 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  40.17 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  38.81 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  40.54 
 
 		 184 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  38.06 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  41.67 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  35.38 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  38.06 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  38.06 
 
 		 182 aa  94.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  29.24 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  34.62 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  33.95 
 
 		 161 aa  94  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  35.82 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  34.57 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  30.97 
 
 		 161 aa  92.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  34.56 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  32.45 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  31.79 
 
 		 164 aa  89.4  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  38.89 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  32.35 
 
 		 161 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  34.62 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  34.62 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  36.97 
 
 		 161 aa  85.5  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  33.1 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  33.13 
 
 		 163 aa  84.7  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  40.57 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  31.21 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  33.33 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  32.31 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  26.14 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  27.27 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  26.72 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  29.77 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  24.85 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  24.81 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  29 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  28 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  29 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  27.48 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  27.82 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  27.1 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4420  Phycobilisome protein  23.31 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  26.87 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  23.48 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  25.77 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  25.9 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  23.93 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  23.08 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  19.4 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  19.4 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  20.9 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  22.95 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  22.86 
 
 		 306 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  23.08 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  45.28 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  45.28 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  24.79 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  53.12 
 
 		 1100 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  21.77 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  22.58 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  25.56 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  56.25 
 
 		 705 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>