211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0938 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 327 aa  687    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  84.1 
 
 		 327 aa  596  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  80.92 
 
 		 326 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  77.68 
 
 		 327 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  70.59 
 
 		 330 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3027  Ion transport 2 domain protein  26.52 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  27.33 
 
 		 521 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  43.33 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.58 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.58 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1183  Ion transport 2 domain protein  33.94 
 
 		 126 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.993846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  39.53 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.83 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  40.22 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  37.38 
 
 		 537 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  38.64 
 
 		 745 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  35.11 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  35.11 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  39.6 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  38.78 
 
 		 408 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  36.56 
 
 		 225 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  36.19 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  33.96 
 
 		 776 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  47.37 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  48.21 
 
 		 526 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  47.37 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  31.86 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  28.16 
 
 		 646 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  39.77 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  31.86 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  29.84 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1941  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 149 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1915  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 149 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  35.16 
 
 		 710 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  39.02 
 
 		 900 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.75 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  30.26 
 
 		 172 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  33.59 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  30.28 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.13 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  39.13 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.08 
 
 		 449 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  41.67 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0114  hypothetical protein  30.28 
 
 		 235 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  41.1 
 
 		 182 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 		 567 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  35.59 
 
 		 290 aa  49.7  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  38.55 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.53 
 
 		 517 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  43.94 
 
 		 497 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 		 448 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  34.58 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  35.14 
 
 		 180 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  31.9 
 
 		 521 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1634  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  31.07 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  38.16 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  33 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 515 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  37.65 
 
 		 1033 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 214 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  36.17 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  39.53 
 
 		 223 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  33.66 
 
 		 446 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.71 
 
 		 483 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  36.78 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  36.78 
 
 		 190 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  37.8 
 
 		 168 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 		 973 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  33.05 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  35.56 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  30.88 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 903 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  39.73 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  36.71 
 
 		 187 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  37.65 
 
 		 493 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  37.36 
 
 		 514 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 386 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0457  Ion transport 2 domain-containing protein  46.34 
 
 		 133 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0447878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 		 493 aa  46.6  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  35.63 
 
 		 279 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  31.43 
 
 		 219 aa  46.2  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  23.05 
 
 		 415 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 268 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  33.75 
 
 		 381 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  30.3 
 
 		 880 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  32.37 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  32.14 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>